益生菌是定植于人体肠道其中有99%就坐落于肠道之中甚至在生殖系统内，是能产生对健康有功效物质的微生物，是生命健康的根源，体内的益生菌平衡，可以有效阻挡外来对人体有害的各种致病菌。人们不正常的生活习惯，如熬夜、挑食、爱吃肉或炸物、喝酒、滥用药物如抗生素等，都会导致人体腔肠内的菌丛的不平衡甚至死亡（药物是不会分好坏菌的），肠道益菌所产生的保护屏障破损，因而容易致病，或者让肠道无法摄取养分，导致人体容易发病，营养不良，也有可能相反，容易发胖，因为你养出来的菌跟著你爱吃肉，爱吃炸物，把身体不该吸收的多余养份通通转给你，而导致容易发胖，所以照顾好体内自己的益菌是很重要的。

根据发表的文献计算，正常人的肠道菌数量是人体总细胞数 (60兆) 的10倍、人体基因数 (两万多个) 的150倍。因此肠道还有人体「第二个大脑」的称呼。

为何会有人称呼肠道为「第二个大脑」，这是因为肠道内层分布许多神经，与人体中枢神经相连，既称为中枢神经，就表示相当是一个中央控制系统与大脑有所连接，当然也就会与大脑相互影响。简单的叙述，有没有肚子饿的时候让你感觉很烦，脑袋无法思考，吃饱后心情就会很开心，肚子闷的时候心情跟著闷．就是类似这样，但事实上是更复杂些的变化，只是碍于篇幅举个例子。

人体肠道表面的黏膜及细胞，在没有益菌屏障保护下，是相当容易遭受外来的致病菌的侵袭并造成危害，形成各种肠子毛病。以最常见的就是便秘、胀气、腹泻、严重者会是需要送医的地步，如：肠发炎、拖久了还有可能会变成肠穿孔、甚至造成死亡。

相反的若是在正常人体中存在适当的益菌菌丛，会把你吃进去的营养合成各种人体所需维生素，帮助你消化食物，促进你的肠道蠕动，不让消化后产生的废弃物堆积在体内，（一般人称呼的宿便），如此就能有效抑制外来致病菌群的生长，甚至会帮忙分解有害、有毒物质等进而排出体外。益菌可通过与致病菌竞争占位，竞争营养成分，而其代谢产物可抑制致病菌的生长，面对外来病菌就会如同一个国家的军队面对入侵者一样，来者是敌便杀，会拒绝坏菌入侵，赶跑坏菌，从而对人体肠道有著重要的保护作用。

其实维护体内良好菌丛环境是简单的，饮食均衡蔬菜水果不可少、睡眠要充足，水分要喝够，运动要足够，如厕作息要正常，生活要平缓，这样就可以培养一支保护人体内的军队，而不用花大钱去买保养养生药品

但是就是现在人忙碌，饮食不正常，暴饮暴食，才造成现今这么多文明病，所幸现在有厂商开发了益菌补充包，让人平常也可以补充，只不过，毕竟这是外来的菌种，在体内有作用的是必须活菌才行，但有些厂商菌种来源不清，也有可能是使用死菌填充，或者是人体不需要的填充菌，购买时最好确保来源是不是活菌，是否符合人体所需，只是这些补充益生菌株会依人体状况存活率不超过一星期，因此建议要持续补充才行。

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