个人认为后白河天皇可算是最有为。

后白河帝即位之初，一直觊觎皇权的崇德上皇就举兵谋逆，史称「保元之乱」。后白河帝果断任用平清盛，源义朝击溃叛军，流放崇德院于赞岐，诛杀源氏栋梁源为义，稳定了政权。叛乱平靖后，后白河帝即发布保元新制，对庄园制度进行了改革，有力的强化了皇权。

平安时代藤原氏通过摄关政治执掌大权，长期架空天皇。为了与藤原氏对抗，白河天皇首创「院政」制度，退位作为太上天皇，通过颁布院宣的方式掌握大权。这一制度被后白河帝发展到了极盛。保元三年后白河帝退位成为上皇后，以院政的形式掌握了二条、六条、高仓、安德与后鸟羽五朝朝政，作为治天之君君临天下。其时政不出于朝廷而出之院厅，藤原氏一族的势力完全被皇权压制。

二条天皇在位时，源义朝联合藤原信赖举兵，引发「平治之乱」，后白河院于乱军之中自力逃入仁和寺避难，可谓有勇有谋。平清盛率军平乱之后，又趁机命清盛铲除了企图拥立二条天皇亲政的公卿大炊御门经宗和叶室惟方，阻止了二条天皇亲政派的阴谋，体现了优秀的政治谋略。

其后平氏一门渐渐坐大，对皇权造成了重大威胁，有鉴于此，后白河院于寿永二年果断潜幸比叡山，下旨源义仲、源行家追讨平氏，收复京都。京都既复，然而安德天皇为平氏劫往西国，后白河院立刻立后鸟羽天皇为帝，并解除平氏一门两百余人官职，没收平家领地，成功巩固局面，稳定人心。然而源义仲亦有不臣之心，于是同年后白河院命源赖朝上洛，借源赖朝之兵铲除源义仲势力，又于次年命源义经、源范赖出兵西海，尽灭平家，收回被平家劫夺的三神器，重振朝威。其后更是命源赖朝平定源义经的叛乱，消灭割据奥州不服王化的藤原秀衡，以一系列强硬的军事行动平定了全国的叛乱势力，奠定了天下太平的基础。

天下平定后，为防止叛军残党死灰复燃，应源赖朝之请，后白河院任其为征夷大将军、日本国总追捕使，又得任命诸国守护、地头，源赖朝遂得以草创天下。赖朝开霸府于镰仓，为日本后世幕府政治之滥觞，后白河院之功实不可没。而源赖朝本人亦为后白河院的远见卓识、工于心计所心折，曾称赞其为「日本国第一大天狗」。

关键是日本从古至今有作为的天皇就那么几个人，也就是你觉得「不用说」的几位。

剩下很多天皇都是充当了贵族、幕府、藩阀的傀儡。

要硬说的话，天智天皇算是我认为比较有作为的天皇了，靠著暗杀掉大贵族上位，上位后积极学习唐朝先进文化，改革遇到阻力后挑起对唐朝的战争，送这些阻挠改革的大贵族当炮灰，改革的差不多了自己果断去世，不给后人留下话柄。

有作为这个词是个褒义词， 有作为讲白了也就是干很多大好事的意思。

后白河天皇一辈子利用别人，结果反而被别人利用，他死的早，运气还算好。到他孙子后鸟羽天皇的时候，上皇的权势早就黄鹤一去不复返了，然而这位还以为自己有多牛逼想武装挑战新生的武士政权，结果就吃瘪了。成了日本历史上第一位被臣子流放的上皇。所以他俩真不能算有作为的天皇

要说除了明治天皇以外的有为天皇，天智天皇确实算一个，大化改新是他的功劳，他执政期间铲除了长期盘踞的苏我氏外戚势力，成为日本皇权的第一个飞跃节点（注意此处的皇权不是天皇权力，因为他一开始也是靠傀儡天皇来发号施令的）。

天武天皇也一样，他不但引入中国的天人感应学说（日本的阴阳寮就是他创立的，其职能等同于中国的太史局和钦天监，是全国天文观测及天文现象解释的最高权威）以强化君权，还创制了《飞鸟净御原令》来贯彻落实律令制（尽管具体落实是由他老婆和孙子来完成的）。

嵯峨天皇也算是个有为之君，他打击了藤原式家的势力，还通过巩固平安京的首都地位来确立新政权的基本盘，他在位期间是日本历史上第二次皇权飞跃发展的节点。

白河天皇算半个有为之君，他利用摄关家族的内讧，曲线发挥天皇作为调停人的权力，通过借力用力的方式再度恢复皇室权力，他在位期间是日本历史上第三次皇权发展的节点。但是他的成功是不可复制的，因为他靠的是扶植新兴地主阶级——武家来打击旧地主阶级——摄关家的办法。

院政的核心是绕过以天皇母亲为首的藤原家势力，以天皇父亲的身份直接干涉朝政，毕竟男尊女卑，爹如果活著，儿子肯定先听爹的而不是娘的。但是藤原摄关家盘踞首辅之位数百年，哪里有那么容易让摄关家的老爷们轻易交出手里的权？于是白河天皇是这样干的——

我们打个比喻，武家相当于周朝先，用武力控制民意，但不合法，长期靠当侯部长也就是摄关家的走狗保持地位。突然某一天，老板，也就是上皇，要侯部长死，就找周朝先来干这脏活。于是侯部长惨死，周朝先又做了老板的走狗。

摄关们并没有真的惨死，但是也差不多了。当时全国的地基本都集中在各地的武家头领手上，这些头领忠于谁，谁就有地。上皇不过是以「天皇之父」的身份争取到了他们的忠心罢了。

当然我们都知道周朝先才不是为了做走狗才苟活的，武家头领们也一样。后面的事情，历史都告诉我们了。

笑川天皇