没有什么区别的，只是所管的范围不同。本质都是为广大师生服务的。

我们学校就有各院系学生会和全院的学生会，我在全院的学生会秘书处。各院系学生会是只管各院系，而全院的学生会就是统管全院，大家都是平级的，没有谁大谁小的区别，学校有什么活动的话，先传达给我们全院的学生会，然后我们再向各院系传达，协助学校把活动开展好就行了。而各院系的学生会的话，一般都是把各院系开展的活动传达给各班，然后协助本学院的老师把自己学院的活动举办好，全院的学生会也可以参加，大家在平时的活动中就是互相帮助，互相支持的。

所以如果你想和全院的学生都有接触的话，就建议你进全院的学会生，如果你只是想在本学院内锻炼下，那进本学院的学生会就可以了。

我简单地说一下吧。院学生会的成员来自于一个学院（系），校学生会的成员来自于每个学院，如果是有多个校区，校学生会有分会，这里说的是占大部分学院的主校区校学生会。校学生会和院学生会的区别最主要的区别在于组织架构及工作内容，校学生会是全校学生代表大会的执行机构，换句话说就是全校学生代表选出全校学生委员会，作为常设机构，校学生会执行全校学生代表大会闭会期间的日常工作，有些大学称之为学生会执行委员会。校学生会对全校学生负责。院学生会一样是一个学院（系）学生代表大会的常设机构，对全院学生负责。校学生会是由校党委领导、校团委指导的，院学生会是两头领导，由院党委领导、院团委指导的，但是在业务上也受校学生会领导。所以说，校学生会和院学生会在日常管理和组织架构中是独立运行的，但是在业务方面受到校学生会的领导。