種子的呼吸強度隨著水分和溫度的變化而變化，在浸種之後，呼吸強度會隨著種子被水浸透，呼吸作用的強度會越來越大。這也是為什麼浸種水變質的速度特別快的原因。與此同時，水中溶氧量的降低也會對種子的呼吸作用產生不利的影響，甚至使種子進行無氧呼吸，會影響種子的芽勢和芽率。在集中浸種催芽基地的浸種過程也是如此，每天浸種一段時間，排水後與空氣接觸一段時間，是種子能正常的進行呼吸作用。

如果是自己浸種，建議購買一個電動浸種催芽器。這種催芽器可以在增溫的同時不間斷的向水內充氧，提升水中的溶氧量。這樣的情況下，基本就不需要排水透氣了，因為水中的溶氧量基本能夠滿足種子呼吸作用對氧氣的需求了。

以上是我對這個問題的一些看法， 如有不當之處請海涵。

現在多數農民還都在用缸等容器浸泡種子，室內溫度大約在15℃左右，這樣需要7-8天左右，浸泡種子需要總積溫在100℃。每天只要攪拌1-2次就可以，目的是增加缸內氧氣，使種子在有氧條件下進行浸種。

如果是人工在容器裡面生稻芽，就要一天一次攪拌，增強透氣性，使下面的稻籽能攪拌上來，發芽均勻，現在種水稻大戶，多數都使用智能水稻發芽機，溫度控制在三十一度，不超過三十二度，省時省力，自帶通氣裝置，不需要攪拌，裝在透氣袋子里，二十四小時拿出涼干就可以播種了