开始在细胞系上面做,敲低后肿瘤细胞生长迁移等能力都下降了。然后裸鼠成瘤,也是同样的结果。想看看过表达的情况,结果和敲低的一样。百思不得其解,不知道往下怎么做了。实验室一直都是做认知这一块的,一个人做肿瘤快绝望了。

自己归纳了一下存在的问题:1.过表达没有在细胞上面做过,没有对照比较。

2.过表达直接成瘤,可能皮下注射的细胞量不一致。(但是已经在计数和注射的时候尽可能一致了)

3.过表达的慢病毒本来是用在神经元的,感染肿瘤细胞用了很大的剂量。(但是荧光,PCR.WB检测都没有问题)4.如果过表达没有问题,真的就是和敲低一样的结果。这个基因还有研究的必要吗?怎么继续下一步的研究呢?


过表达不要上来就做裸鼠吧。。。这个情况可能性很多,要看是什么基因,起什么作用的,在肿瘤细胞过表达看看有什么效果


怎么敲的?表达一个额外的载体对细胞是很大的负担,必须对比EV,最好有scramble。另外stable cell line (包括CRISPR)如果经过抗生素或colony选择,在选择过程中会发生生存竞争,往往会带上一些额外的突变
体内实验本来就很复杂很难解释,其实很多拿到预计结果的情况,如果深挖机制也不一定和预想的一样。某些基因会在多通路中起不同作用,表达量或修饰的调控都收到严格调控,很微妙。比如akt,都知道在肿瘤生长和迁移中起作用很大,也有人就发现也促进细胞衰老。具体问题没有细节确实没法展开,但没有预期结果,尤其是体内实验,说实话,很正常。我觉得既然有敲低说明你们有预期机制,其实也不一定要过表达。要真想研究机制就回细胞,或者转做转录或生化吧
给的信息太少,这个有可能是你的目的基因和你要研究的肿瘤毫无关系。多设对照,看看是不是其它条件导致的实验结果。
钱如果允许,在小鼠上做个Cre/lox敲除看看?没钱就算了。如果想大力搞,我觉得还是要做个Cre/lox系统的。确实有很多基因的调控是根据剂量调整的,可以考虑做个荧光定量PCR定量分析一下表达量,如果两倍表达量和1/2表达量都致癌,其他剂量不致癌,那绝逼是根据表达量调整的。


你可以去找Sadler聊聊,毕竟他的宝贝uhrf1上调下调都致癌(笑
你可以先利用各大资料库看看你这个基因在肿瘤中的表达情况,到底是癌基因还是抑癌基因,还是和正常对照没有区别,这样再进一步实验验证才有意义
先把通路关系搞清楚在谈实验细节。首先是否有某些旁路或代偿性通路存在。另外动物成瘤不一定与你过表达的蛋白有直接关联,把瘤子取出来做你观察蛋白的免疫组化或者wb或许更有价值。过表达不在细胞水平做免疫荧光,wb,就直接上动物实验也太不严谨了,起码要先看下转染的效果,再决定是否做动物实验。


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