针对前总统马英九批评民进党政府反对自经区，是因为反对中国大陆一事，总统蔡英文今（12）日受访时表示，自经区是比较不符合现在的需求，现在要的是强化台湾整体竞争力，让产业进入另一个阶段，而不是停留在加工、出口的情况。

蔡英文指出，很多人提自经区是著眼于中国大陆的货品，能够在这里加工以后再出口，这确实也是让她最担心的地方，中国货品透过自经区以后就转换成台湾货品，造成台湾货与中国货在国际市场上混淆，她深怕会影响到台湾制造的品牌形象。

蔡英文说，美中贸易冲突，美国对中国货品施加惩罚性关税，如果透过台湾自经区再转出，势必影响台湾货品销美，因此必须防止台湾货被中国货混淆，而受到这样的惩罚。

至于台北市长柯文哲日前批评蔡英文的外交策略是「亲美抗中」。蔡英文表示，柯文哲的讲法不尽确实也过度简化，她的政策是保卫台湾的主权，保卫台湾民主自由生活方式，在两岸维持台海的和平稳定，在区域要做区域和平稳定的贡献者。