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日本幕府是个「双头政治」，镰仓时代就是「朝廷——幕府」的双轨并行统治体系。只不过武家强势的时候公家系统对地方的作用微乎其微（历经几百年的土地私有化进程，朝廷的土地早就被权臣，寺庙和地方势力瓜分殆尽），室町虽然自己乱但好歹也是这个体系，江户相对稳定，以这个体系为基础自己设计了一套幕藩体系。

但这里需要指出的一点是，虽然日本在幕府时代是两个中央两套官僚系统，但在名分上，幕府是从属于朝廷的。幕府的最高职务「征夷大将军」，每次册封都是由朝廷盖下最后的橡皮图章【幕府自己商量好让谁当，然后把名单材料交给朝廷，朝廷走个过场批了】。因此，幕府纵然有统治天下的实力，但他却不敢动「推翻」朝廷的心思，这一点在镰仓幕府表现的尤为明显，举个小例子：承久之乱。

承久之乱时，北条当时号召忠于幕府的武装力量的名义是什么？「清君侧」【当然原话不是这个，意思是这个意思】。而当时的朝廷已经宣布镰仓为「朝敌」，也就是朝廷的敌人了。就算是在这样的情况下，北条在军事上取得对朝廷的压倒性胜利后，也仅仅是流放了三位和幕府作对的上皇，以及处置了相关敌对的公卿，并没有废除朝廷，原因很简单：废除了朝廷，也就等于废除了幕府的合法性。这种动摇统治根基的傻事，任何一位幕府将军都是不会去尝试的。用中国的一个类似但并不100%相同的例子来说，你会去指望曾国藩的湘军去推翻清朝么？

回答里有人提到了室町、织田信长和德川家。多掰扯两句。

室町的情况比镰仓要复杂：镰仓的政治体系是：公家朝廷被架空，幕府将军被架空，实权掌握在将军的二把手——职权手中，而这个职位是北条世袭；室町的将军，本质上是军阀的联盟会长。除了四职三管之外，关东，东北等各大公方也是自己拉山头。因此室町的将军至始至终都在做一件事：削藩。这里要注意的是，虽然大家各自拉山头互相打架，但依旧是在室町的武家体系下。脱离该体系最直接的坏处就是失掉名分。然而将军还没来得及削完自己就乱了【应仁之乱】，因此室町的混乱是体制内的混乱，但体制本身，尤其是基层依旧是基本完好的——除了东边的主要公方被后北条一个个拔了之外。各国守护依旧还是有，只不过将军不知道守护变成了谁，反正下面报上来是谁将军都会批，只要钱管够。当然还有更多是「自封」的守护，还有各类公家官职。因此在这样的情势下，无论是大势力还是小势力，反而都特别注意依附于室町的名分行事——这样可以在未来的地缘政治斗争中占得先机，而不是想著去逆反。就算强如织田信长，废掉室町幕府也已经是1575年，坐拥近畿和中部地区，可以分头抵御对手们的联合进攻的事了。

如果用中国人的思维来理解，肯定觉得另开幕府或者推翻朝廷更省事。但考虑到日本的历史情况，可以得出几个基本结论：

1.武士先天自带的幕府系统属性，决定了他们无法反抗朝廷。更何况万世一系的日本朝廷同样也是其神道教的宗教领袖，推翻的政治风险过大。上一个自立新皇，与京都分庭抗礼的已经凉了好几百年了。

2.推翻现有幕府，另立幕府或者其他统治体系是有人想过的，这也是当日本战国以来的统一进程被推进到一定程度的时候，在位之人都会考虑的事：信长是军团长制，无幕府之名行幕府之实，但构架较为粗糙；秀吉是关白的公武合体系统，利用公家现成的体系安置武将，优点是效率高，缺点是公卿化速度快；德川是开新幕府，缺点是见效慢，设计复杂，优点是稳定，对地方的管控也更彻底。

因此概括说起来就是：

推翻朝廷可行性为零，且政治风险极高

倒幕重开或者重新确立统治体系，日本历史上是有的，只不过各人条件不同经历不同，最后选择的路也不同。

因为那个年代的天皇，相当于衍圣公孔府，基本上是一个宗教职务，木有世俗权力，存在感是想当的低，甚至很多日本农民，都不知道这位「天照大神在人间的代表」是个有血有肉的真人，以为他就是个传说中的神仙的古代日本人可不在少数。而且更要命的是自从没有了世俗的权力，天皇朝廷连日常生活质量都惨不忍睹，天皇的侍卫吃饭都要掺3成糠皮，天皇吃个咸鱼还要留下骨头泡饭再吃一顿，请大臣吃饭买不起鸡肉只能用豆腐干充数.......

而将军才是世俗日本的无冕之王，所以才有大明皇帝封足利义满为「日本国王」，赤果果的就把天皇放在一边置之不理了。

有人或许会问，那如果将军篡位当了天皇后，继续行使将军的权力，管社会大小事情，占尽人间享乐利益，行不行？回答是不行！因为日本传统上，天皇是不能管世俗的事情的，好比印度的婆罗门不能亲自掏大粪，否则就是逆天而行，丧失身份了，天皇就是一块活的神主牌，威严端坐著不动才是好天皇。

所以说，你说你要是将军，愿不愿意放著号令天下吃香喝辣的将军不做，去做穷逼无人问的天皇？

像欧洲日本这些封建贵族国家不是你有权力就能当帝王的，想当王你要有王室血统，不然所有贵族阶层的都会反对你，除非你牛逼把所有反对你的人都干死。历代日本的将军都是靠大贵族的支持当上将军的，如果为了图一时虚名得罪所有贵族阶层那不是自掘坟墓

很多答案都指向虚君，无实际权力没必要推翻，宗教云云。那么，反问一句，中国历史上虚君多了，为啥都被推翻了？周王室算不算是第一代华夏领袖，宗教意味强不强？

这么多军政强人最终都没另起炉灶，大权旁落的这一千年，天皇这一家子运气够好。

运气够好就是答案。历史的偶然性也是历史。

渡海而来的扶余（疑）族领袖征服列岛，逐渐丧失权力，并且在全民族面临亡国灭种的危机时，再一次被抬出来作为精神图腾统领全族富国强兵，带领全族成为近代史环球第一个正面战场击败白人，第一个非白人的发达国家…当年高呼的万岁转眼居然已经过了1/4个万年，也算是个奇迹了。

平安时代有人这么干过，可惜军事上失败了，间接造成了祸害日本700年的幕府制度，他就是平清盛。包括天皇都是平家血脉，四海之内皆平氏，这样的高度集权制度却被腐朽的幕府取代，可谓坛浦之后无日本。

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