SF3B1基因K700E突变驱动的MDS/白血病案例分析

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最近有病人家属看到我之前写的关于白血病必须测序的文章, 然后让病人做了全外显子测序并将报告发给我,这里我写一下简单的遗传分析。

首先,测序公司发现SF3B1基因存在K700E错义突变,鉴于有相关报道,报告认为这是致病突变,这一点我没有异议。

SF3B1编码剪接体中一个重要蛋白,突变以后影响RNA的剪接过程, 机制见下图。

另外交待一下, SF3B1突变是血液病中常见的一个突变,下面的这篇新英格兰医学杂志文章就有报道:

其中血液病中最常见的就是K700E突变,见下图:

SF3B1 K700E突变的存在并不一定代表致病, 真正的实锤是下面这篇以老鼠为模型的Cancer Cell文章,在造血干细胞中引入一个拷贝的SF3B1 K700E突变,发现可以致病。

到这一步, 我才放心的告诉病人SF3B1 K700E是致病突变。

但是事情并没有结束,存在两个问题,第一是有没有针对SF3B1突变的靶向药物,第二是病人该如何治疗。这时候我要求做测序公司做重分析, 重点看TP53, DNMT3A, TET2, SETDB1和ASXL1这5个基因, 我就不解释为什么了。

结果发现TET2有无义突变,意味著一半的TET2蛋白没有功能, 另外TP53 存在P72R错义突变。 这时候我建议病人使用低剂量地西他滨治疗,原因是因为我之前写的文章,Tim Ley在新英格兰医学杂志上发表结果,报道存在TP53突变的MDS/AML病人对地西他滨的反应比较好。

这个案例可以让你了解,拿到测序报告以后我做的事情中冰山的一角, 阅读测序报告,搜索突变资料库,查阅医学研究文献并进行分析,出具结论,所有这些步骤都需要时间。

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