蛋白質組與基因組相對應,也是一個整體的概念,隨著基因組學研究的不斷深入,蛋白質組學已逐漸成為研究熱點,對蛋白組學的研究可以使我們更容易接近生命的機理本質,但探究成千上萬的蛋白質特性也是一個重大的技術挑戰。蛋白組學研究不知該如何下手?定性分析、定量分析傻傻分不清楚?相對定量、絕對定量不知如何選擇?不要擔心,奧維森幫您打包解決所有困惑。

蛋白質組(Proteome)指的是某一時刻或某一狀態基因組表達的所有相應的蛋白,即細胞、組織或機體全部蛋白質的存在及活動形式,其是一個動態概念,它是在組織、細胞的整體蛋白質水平上,探索蛋白質作用模式、功能機理、調節控制以及蛋白質群體內的相互關係、從而獲得生命活動調控網路的全面而深入的認識,以揭示生命活動的基本規律。

技術流程

技術方法

應用方向

案例分析

定量蛋白質組學與翻譯後修飾研究共同揭示豆科植物共生固氮機理[1]

研究背景

生物固氮作用在生態圈的氮循環發揮重要作用,豆科植物的固氮機理也是農業與植物科學研究的熱點。

研究目的

通過蛋白質測序分析感染根瘤菌苜蓿的七個部位(根、莖、葉、花、種子、頂端分生組織以及不同發育階段的根瘤),探究苜蓿與根瘤菌共生固氮機理。

研究結果

通過蛋白質組學分析(label-free),共檢測到23,013個蛋白質(苜蓿19,679個,根瘤菌3,334個);修飾蛋白組學分析發現20,120個磷酸化位點和734個乙醯化位點(TMT修飾)。進一步整合轉錄組、蛋白質組和修飾蛋白質組數據進行聯合分析,鑒定到了苜蓿核心蛋白質組(多部位共表達蛋白子集)和根瘤蛋白質組(參與根瘤生長及調控的特異蛋白子集);在此基礎上建立共生固氮調控網路,發現核心蛋白,對根瘤固氮機理研究起到巨大的推進作用。

圖1. 環形蛋白質組學圖譜(circular proteome maps,CPM)

圖2. M.truncatula 中的宿主因子的時空表達和 S. meliloti 中靶標

總 結

說了這麼多,不知道各位對蛋白組學有沒有更深入地了解,蛋白組學也是一門很深的學問,接下來小編也會分享更多的蛋白組學乾貨給大家,若您感興趣,歡迎留言或者聯繫我們。

參考文獻

[1] Marx H, Minogue C E, Jayaraman D, et al. A proteomic atlas of the legumeMedicago truncatula and its nitrogen-fixing endosymbiont Sinorhizobium meliloti[J]. Nature Biotechnology, 2016, 34(11):1198.

來源:奧維森基因科技

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