东非、南非古代基因组－非洲遗传史，与全人类的起源
非洲有著悠远绵长的人类演化史，至今研究却相对稀少。这个 2017 年的论文，获得 15 个来自东、南非的古代基因组，让我们更加认识非常繁复、所知却十分有限的非洲遗传史。另外也提供惹一些，智人起源的线索。
Reconstructing Prehistoric African Population Structure
样本位置。
15 个样本都位于东非或南非，最老的距今 8100 年，最年轻的 400 年，是货真价实的「古代」基因组，覆盖率普遍很糟，不过仍足以后续分析。从南往北，南非共 3 个，2 个距今约 2000 年、另一个 1300 年；马拉威 7 个，介于 2500 到 8100 年；坦尚尼亚 4 个，距今 600 到 3100 年；肯亚 1 个，距今 400 年。另外就是之前发表，衣索比亚 4500 年前的 Mota。
样本资讯。
和现代族群的关系方面，古代南非人，与现代的南非人很像，古代东非人，却比较接近现代的西非族群；地理介于其间的马拉威，遗传上也介于其间。古今东非人之所以遗传差异明显，主要应该是因为，距今 3000 年以后，有大批可以追溯到中东的 DNA 流入，影响现代东非族群的遗传组成。
样本 PCA。
在人类遗传学研究中，常常能见到南非的「桑族（Sans）」代表。非洲和世界上许多地方一样，数千年前也经历农夫族群的大迁徙（例如班图语族），大尺度的情欲流动，剧烈影响惹遗传组成。而桑族被认为与这些情欲交流没有多少关系，是所有人类族群中，与其他人分家最久的一群人。然而，与古代南非人相较，现代的桑族人基因组中，却仍有 9% 左右的外来 DNA。
各样本的祖源关系。
南非东北方的马拉威，是这回最大的惊喜。距今 2500 到 8100 年前的 7 位古人，彼此间遗传上差异不大，代表当地族群有著相当的延续性，持续至少五千年之久。古代马拉威人遗传上，可以粗略视为与其同时期，更北方的东非、加上较少的南非、以及少少的西非祖源，三者共同组成。惊喜点在于，现代的马拉威人几乎完全没有配备，与桑族代表南非祖源相似的 DNA；也就是说我们所知的「南非祖源」，其实一度曾经分布到更为东北的区域，只是后来都消失惹。
北非 15000 年前摩洛哥 Iberomaurusian 人，遗传与欧洲毫无关系
左：南非 2000 年前古人，与各地族群的遗传关系。右：衣索比亚 4500 年前古人 Mota，与各地族群的遗传关系。
左：西非代表 Mende 族群，与各地族群的遗传关系。右：坦尚尼亚 3100 年前古人，与各地族群的遗传关系。
还有很多分析，先略过，直接跳到族群迁徙史。智人，第一：是先起源于东非，再移民到西非、南非、非洲以外；或是第二：欠缺一个较为明确的起源地，反而是各地长期情欲交流的结果？
智人起源假说 1 号：起源于东非，再移民到西非、南非、非洲以外。
智人起源假说 2 号：欠缺较为明确的单一起源地，而是各地长期持续情欲交流的结果。
依目前资讯，两个假说都有机会（别再打架惹......疑，你们怎么继续打啊！）。起源自东非，再移民各地，这个剧本很容易想像。另一可能性，多地长期持续情欲交流，假如为真的话，根据模型估计，会有「一群人」与其他人分家的年代还在桑族更早之前。桑族约莫是 20 万年前离开的，也就是说这群人分家非常非常早，超过 20 万年前。他们能否算是智人，是否有对应的化石呢？这需要 DNA 与其他领域，共创未来才能回答。
马拉威的死人骨头，是如何取得的呢？来看看古人类学家的田野记录：
Bonding over bones, stones and beads
新闻稿：
Ancient human DNA in sub-Saharan Africa lifts veil on prehistory
Science 之前的新闻：
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