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可能是不了解歷史也不了解科學，導致了題主這樣的誤會吧。

達爾文進化論當然受到過主流科學的挑戰，不然牛津大辯論里吵的不可開交的那幫科學家都在幹啥？

遺傳學剛剛冒頭的時候進化論也老緊張了：你達爾文不是說連續漸變嗎？怎麼孟德爾的豆子要麼黃要麼綠就沒有一個半黃不綠的過渡形態咧？要不是費舍爾大神力挽狂瀾進化論還不曉得要被踩成什麼樣呢。

中性學說橫空出世的時候多少深受適應論影響的學者渾身直冒冷汗？古生物學家高舉間斷平衡論的旗幟殺向進化生物學的時候又有多少學者夜不能寐？

好在跟所有現代科學理論一樣，進化論也樂於承認錯誤並做出改正。自達爾文老祖那個最初版的進化論開始，在其後的百餘年間不斷有各路科學家對進化論做出補充做出完善做出修正，才有了我們今天這版現代進化論。

甚至就在當下，科學家們也還在吵吵進化論是不是需要再來一次大修：2014年Nature刊登了一篇題為《我們是否需要重新思考進化論？》的評論，正反雙方兩大波進化生物學家激情對噴，精彩絕倫。

這就是科學。

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因為它就是主流

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一直都在被挑戰，只不過還沒被推翻。目前絕大多數的科學證據都是支持進化論的。

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經過這麼多年的各專業人員的辛苦，對同一物種和大致相似的身體結構上，從化石和現有特種的外形相關的研究上建立了進化樹，看似完整繁雜，提供了進化的可能性。如果現在的物種是先進的，可以理解為進化來的，但隨著分子生物學對細胞結構的深入研究，基因遺傳編碼與物種性狀的關係，即編碼確定功能的原理，而編碼的複雜精密有序龐大，加之以遺傳信息的傳遞機制等等，對進化論的突變經環境選擇形成今天的模樣的理論，形成了強大的挑戰，其不符合邏輯之處也越來越多，並不是沒有受到主流科學的挑戰，相信反對意見會逐漸形成主流，畢竟進化論本身也在一點點修改，已不是我們學校課本中說的模樣了，這和社會的整體教育體系的慣性，社會經由長時間形成的共識有關。會慢慢改變的，想想當初進化論還是歪理邪說的時候，一步步專為社會主流觀念的過程，在挑戰中，會慢慢接近真相的。物種產生由自然形成是不可能的，跨物種進化是通過突變所致也是不可能的，可能的是同一物種的多樣化，所有的物種微觀層面的運作不是我們想像的那麼簡單，其複雜性結構之精妙是不能通過概率來解釋的，內部部件之間的協調需要信息的交流，而信息的參與也不是突變會產生的，隨機的突變導致有序性也不是時間夠長機會夠多能解決的，其概率小到不可思議，但是有指導的突變卻是可能的，請耐心等待，接近真相的過程總會反反覆復。

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