一般來說，冷鏈物流中心在規劃設計之初，冷鏈物流行業內的業主需要對以下方面有一個基本的確定：

1. 建築結構形式。是用土建結構（鋼筋混凝土結構），還是鋼結構，或其他結構（如庫架合一）。

2. 建築樓層。是單樓層還是多樓層設計。

3. 建築的自動化程度。是否考慮自動化倉庫、自動分揀系統等設計。

4. 製冷系統。一般是氨系統或氟系統，其中還有其他冷媒可進行選擇，但不具普遍性。

5. 預估的存儲容量。在建築結構選擇方面，本文對3種差異性較大的結構進行對比分析，詳見表1。其中部分資料是啟達喬泰公司在中國大陸及台灣地區近30年的冷庫建造經驗的總結，可能會在不同情況及條件下有所不同。

在建築樓層設計方面，現代冷鏈物流中心在用地不是特別緊張的情況下， 基於物流動線及物流效率以及投資成本考慮，一般建議採用單樓層式的高位貨架。

在自動化設計的選擇方面，冷鏈物流中心應比常溫物流中心更為謹慎，低溫環境中設備運行的風險及故障損失均應納入考慮範圍。在冷鏈物流中心規劃中，常採用的幾種自動化方面的設計包括：製冷系統的自動控制系統、低溫環境中的自動倉庫系統、低溫環境中的自動流水線及傳送帶系統、低溫環境中的DPS（數位揀選或分撥）系統，此外還包括其他一些方面。

在製冷系統的選擇方面，國內大多數業主會綜合權衡氨系統和氟系統的利弊與適用性，選擇其中的一種作為主要冷媒。兩種製冷系統的比較見表2。當然，氨與氟內部在環保性、機組的適用性、安全性能、經濟性、配套主機價格等具體細分不同的冷媒型使用形式。

在冷鏈物流中心存儲容量及物流中心總面積預估時，最好先做數據分析及流程設計，再最後確認存儲方式、作業區面積及各配套設施的布局方案，確認在滿足需求的情況下，計算各區域面積及存量水平。這樣可使冷鏈物流中心在建成後使建築與實際營運需求偏差最小。

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