生物信息学100个基础问题:问题及答案目录
写在最前面的话
从去年6月开始,我们一直在尝试著做生物信息学的知乎Live,尝试著把我们知道的一些基础的,入门的生物信息学知识分享给大家。在分享的过程中,我们受益颇多,也深感我们自己还有很长的路要走。
今年春天,我们想尝试一个新的模式,就是把我们自己学习生物信息学过程中遇到的问题整理成100个生物信息学基础问题分享给大家。我们期待著,通过这100个生信问题的探索,我们能够成为志同道合的朋友;期待著一些朋友能从小白成长为能够独立承担生信课题的小牛;期待著我们一起去合作,用生物信息学的方法探索点什么!
本篇文章是各个问题及答案的链接目录,会持续更新。希望大家多多点赞,转发!
如果,你之前还在畏首畏尾,觉得生信是一个很难的事情,那么请从现在开始,从今天开始,让我们一起开始学习!
「种一棵树,期待著成材,最好的时间是十年前,其次就是现在。」
第1~5题问题及答案
问题
生物信息学100个基础问题 —— 第1题 FASTQ与FASTA
生物信息学100个基础问题 —— 第2题 测序技术初探
生物信息学100个基础问题 —— 第3题 Illumina测序技术细节探究
生物信息学100个基础问题 —— 第4题 Illumina测序技术细节探究 II
生物信息学100个基础问题 —— 第5题 测序建库的adapter
答案
生物信息学100个基础问题——第1~ 5题 答案公布
第6~10题问题及答案
问题
生物信息学100个基础问题 —— 第6题 读懂FastQC报告 Part I
生物信息学100个基础问题 —— 第7题 读懂FastQC报告 Part II
生物信息学100个基础问题 —— 第8题 读懂FastQC报告 Part III
生物信息学100个基础问题 —— 第9题 读懂FastQC报告中的duplicate问题
生物信息学100个基础问题 —— 第10题 读懂FastQC报告之adapter与kmer
答案
生物信息学100个基础问题——第6~ 10题 答案公布
第11~15题问题及答案
问题
生物信息学100个基础问题 —— 第11题 使用cutadapt去除adapter
生物信息学100个基础问题 —— 第12题 trim与cutadapt 先用哪个?
生物信息学100个基础问题 —— 第13题 从双序列比对开始学起
生物信息学100个基础问题 —— 第14题 你应该知道的BLAST
生物信息学100个基础问题 —— 第15题 知道了BLAST,可是你知道BLAT吗?
答案
生物信息学100个基础问题——第11~15题 答案公布
第16~20题问题及答案
问题
生物信息学100个基础问题 —— 第16题 高通量测序的回贴问题 I
生物信息学100个基础问题 —— 第17题 高通量测序的回贴问题 II (SAM文件与BAM文件)
生物信息学100个基础问题 —— 第18题 高通量比对的质量MAPQ
生物信息学100个基础问题 —— 第19题 SAM/BAM中的CIGAR值
生物信息学100个基础问题 —— 第20题 SAM/BAM中的其它重要信息列
答案尚未公布
第21~25题问题及答案
问题
生物信息学100个基础问题 —— 第21题 SAM/BAM中的附加标记信息
生物信息学100个基础问题 —— 第22题 都有了SAM文件,为什么还需要BAM文件?
生物信息学100个基础问题 —— 第23题 转录组的比对与基因组的比对有何不同?
生物信息学100个基础问题 —— 第24题 GFF,GTF到底是什么?
生物信息学100个基础问题 —— 第25题 GTF/GFF的注释是怎么来的,应该从哪里下载?
答案尚未公布!
番外
生物信息学100个基础问题 —— 番外1: 不学Linux做什么生信?
生物信息学100个基础问题 —— 番外2: 用Anaconda快速搭建生物信息学分析平台
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知乎 Live 链接-生物信息学-孟浩巍
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