本刊報導，前總統馬英九日前受邀到國民黨中常會上說明三中案交易過程，不過吳敦義卻說不是要為誰背書，親馬人士質疑吳敦義當時擔任祕書長，怎麼會與他無關。吳敦義今受訪時表示，三中處理時，他不是黨的工作同仁，「我為什麼要出面說明？」自己只是針對中影「似乎有一點，跟我所想的買賣基本規則有點差別」，所以才簽呈給代理主席吳伯雄。

本刊報導，對於吳敦義在中常會的態度，親馬人士表示，馬英九確實深感不解，認為三中案是黨產，他身為黨主席，在廣電三法還有民進黨政府追殺的壓力下，為了黨的命運與未來做了這些處理，歷任黨主席都應該知道他當時的為難；更何況吳敦義現在是黨主席，未來總統大選民進黨一定會打黨產議題，馬被起訴就是最重要的例證，黨的態度非常重要。

本刊報導，該人士並提出兩點質疑，一是吳敦義當時擔任國民黨祕書長，三中案怎麼會跟他無關；二是北檢提出吳敦義曾上簽呈給黨主席吳伯雄，形容中影案「銀未入手，而貨已失控，其不合理交易原則至明」「此一回算機制，3年內必將遭受各種魔考」，吳也沒出面說明非常奇怪。

吳敦義今表示，他2008年7月擔任立委時，兼任國民黨副主席兼秘書長，當年7月4日，他覺得三中交易裡的中影部分，「似乎有一點點跟我所想的買賣基本規則，有一點差別」，所以將「銀未入手，貨已失控」的簽呈，給當時的代理主席吳伯雄。吳伯雄則批示交由副祕書長張哲琛，「請張副祕書長妥善處理，確保黨產」，當時馬英九已經就任總統。

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