沒有什麼區別的，只是所管的範圍不同。本質都是為廣大師生服務的。

我們學校就有各院系學生會和全院的學生會，我在全院的學生會秘書處。各院系學生會是只管各院系，而全院的學生會就是統管全院，大家都是平級的，沒有誰大誰小的區別，學校有什麼活動的話，先傳達給我們全院的學生會，然後我們再向各院系傳達，協助學校把活動開展好就行了。而各院系的學生會的話，一般都是把各院系開展的活動傳達給各班，然後協助本學院的老師把自己學院的活動舉辦好，全院的學生會也可以參加，大家在平時的活動中就是互相幫助，互相支持的。

所以如果你想和全院的學生都有接觸的話，就建議你進全院的學會生，如果你只是想在本學院內鍛煉下，那進本學院的學生會就可以了。

我簡單地說一下吧。院學生會的成員來自於一個學院（系），校學生會的成員來自於每個學院，如果是有多個校區，校學生會有分會，這裡說的是佔大部分學院的主校區校學生會。校學生會和院學生會的區別最主要的區別在於組織架構及工作內容，校學生會是全校學生代表大會的執行機構，換句話說就是全校學生代表選出全校學生委員會，作為常設機構，校學生會執行全校學生代表大會閉會期間的日常工作，有些大學稱之為學生會執行委員會。校學生會對全校學生負責。院學生會一樣是一個學院（系）學生代表大會的常設機構，對全院學生負責。校學生會是由校黨委領導、校團委指導的，院學生會是兩頭領導，由院黨委領導、院團委指導的，但是在業務上也受校學生會領導。所以說，校學生會和院學生會在日常管理和組織架構中是獨立運行的，但是在業務方面受到校學生會的領導。