撰文 | 黃蔚
責編 | 兮
反義lncRNA(antisense lncRNA)是指由基因(通常是蛋白編碼基因)的反義鏈轉錄,並與該基因的mRNA存在序列重疊的RNA分子。隨著對非編碼RNA研究的深入,研究發現約70%的基因均有反義lncRNA【1】。更為重要的是,反義lncRNA往往與其正義鏈基因的表達存在相關性,提示反義lncRNA可能廣泛地參與了蛋白編碼基因的表達調控。
目前,關於反義lncRNA影響正義鏈基因表達的作用機制,主要有3類:1.反義lncRNA的轉錄過程,抑制正義鏈基因的轉錄,該機制認為反義鏈轉錄事件本身,而不是反義lncRNA,調控了基因的表達。2.反義lncRNA結合DNA或組蛋白修飾酶,調控所在基因座位的表觀遺傳學,從而影響正義鏈基因的表達。3.反義lncRNA與正義鏈mRNA通過鹼基互補配對結合,影響mRNA的可變剪接等【2】。
2019年4月4日,來自美國哥倫比亞大學的Tom Maniatis教授在 Cell 上發表研究Antisense lncRNA Transcription Mediates DNA Demethylation to Drive Stochastic Protocadherin a Promoter Choice。該研究首次發現反義lncRNA的轉錄可以影響DNA甲基化,進而改變染色體結構,促進增強子與啟動子的結合,調控Pcdhα基因的表達。該反義lncRNA的作用模型也解釋了Pcdhα基因的可變外顯子選擇機制。