总统府宣布法务部长邱太三将转任国家安全会议咨询委员，不过邱太三至今仍未点头答应接任新职。邱太三今天(13日)表示「还在考虑中」，他仍希望能回到学校教书，感谢总统府的好意，也需要再跟学校沟通借调的问题。

法务部长邱太三在这波内阁改组中去职，由调查局长蔡清祥升任法务部长，而总统府也随即宣布邱太三将转任国安会咨询委员，并在近期内上任。不过邱太三却表示这件事情「还没有明确的定论」。

究竟是否同意转任国安会咨询委员一职，邱太三13日出席法务部同仁为他举行的欢送会时受访表示，他还在考虑中，仍希望能回到学校教书，所以还没决定要接受新职。邱太三说：『(原音)基本上我刚刚提到我主要要回学校，我应该没有太多时间可以到台北工作，我当然感谢府里面的好意，只是在这个时间点上，还要再跟学校沟通。』

外界认为，邱太三就任法务部长2年多来未执行任何死刑，再加上得罪了正保外就医的前总统陈水扁，导致「被迫下台」；但邱太三再度否认相关说法，重申他是因为学校借调期满，学校希望他尽速归建，他是为了自己年资计算不会中断的「小利」而请辞。

而媒体报导指出，邱太三在这波内阁改组中去职后，原本将转任总统府副秘书长，但遭邱太三婉拒，之后总统府秘书长陈菊才又劝说邱太三接任国安会咨委。邱太三在欢送会上自己爆料绝对不接总统府副秘书长一职的原因。他说：『(原音)我说那个位子专门要处理，这句话对女生没有什么粗的意思，现在在形容的，那个位子就是要处理干人干话，我对我来讲，我一点兴趣都没有，所以我绝对不会去的，』

至于准法务部长蔡清祥12日与邱太三密谈了2个小时，外界好奇是否有触及死刑议题？邱太三说「没有」，他并强调法务部的立场很清楚，没有探讨废除死刑，也没有排除执行死刑，只是在两公约国内法化后，已订有执行要点，必须先检视每个步骤，若都完成了，或许就是执行死刑的时间点了。