在被駐伊美軍關押670天后，2005年10月19日，在巴格達戒備森嚴的“綠區第一法庭”上，薩達姆和前政權7位高官首次出庭受審。當時，伊拉克領導人和他們的美國顧問經過反覆磋商後，選擇“杜賈爾村案件”作爲對薩達姆提出了第一項正式指控。庭審中，薩達姆非常傲慢，承認自己當年下令法庭處決了涉案村民，但他強調那只是“依法行事”，自己是國家元首，有權懲罰暗殺國家元首的罪犯。他申辯道：“我沒有罪，我是清白的！”“我保留憲法賦予我作爲伊拉克總統的權利。我不承認有什麼機構授權你來審判我，也不承認對我的指控，因爲任何建立在毫無根據的謊言上的指控都是莫須有的！”

首次與薩達姆公開較量中，阿明在薩達姆咆哮公堂時，顯得有點文弱，但他以冷靜剋制的表現獲得衆多好評。由於控辯雙方各執一詞，審判陷入僵局，加上36名證人因爲害怕拒絕出庭作證，阿明決定退庭並將審判推遲40天。11月28日，第二次庭審如期進行，經過幾次交鋒，阿明逐漸摸清薩達姆“咆哮、抱怨、跑題”等“三斧子半”花招，逐漸自信起來，氣勢上不再示弱。然而在整個審判過程中，阿明堅持職業操行，對待薩達姆很客氣，儘量保持冷靜和相對公正。他表示道，“任何人在被證明有罪之前都是清白的“。阿明的表現得到了許多法律界專業人士的肯定，他們認爲如果阿明在法庭上用粗暴的手段對付薩達姆，只能使特別法庭的公正性和合法性受到更大的質疑。

然而，許多伊拉克什葉派政要和宗教領袖對阿明審判薩達姆的“軟弱”感到不滿，自然也引起美國的不滿。阿明曾私下抱怨說，伊拉克政府什葉派高官對他領導的特別法庭總是指手畫腳、橫加干涉，使法庭獨立行使審判的權力受到幹擾。2005年1月15日，被逼無奈的阿明提交了辭呈。很快，在美國牽頭下，同樣來自庫爾德地區的大法官阿卜杜勒·拉赫曼被任命爲主審法官。拉赫曼與阿明不同，他曲意逢迎當局意旨，經過近一年審理，於當年11月5日以“反人類罪”判處薩達姆死刑。當判決結果公佈後，薩達姆辯護律師強烈質疑公正性，薩達姆高呼宗教口號，大聲喊道：“伊拉克人民萬歲！敵人去死吧！偉大的國家萬歲！敵人去死吧！”

阿明辭職後，一直都在密切關注薩達姆案的審理，對於薩達姆最終的結局他並未公開表態，不久淡出了公衆視野，算是做到了“全身而退”。而自從做出死刑判決後，拉赫曼雖然得到伊拉克當局者的讚賞，但日子過得並不安穩，不斷受到薩達姆死黨死亡威脅，只有帶着家人到處躲藏。薩達姆被執行死刑後，伊拉克人並未迎來和平穩定，局勢依然混亂，國家成爲了“恐怖主義者的樂園”。據悉，2014年6月，69歲的拉赫曼在庫爾德地區逃亡期間，結果被“伊斯蘭國”恐怖分子抓住了，雖經求饒，但最後還是被殘忍殺害了。