在佛教共同乘的「外皈依」中，以佛陀為本師，將佛法做為修行解脫依循的正道，以僧眾為修行助伴，以此為三寶而頂禮皈依。「無上導師是佛寶，無上救護是法寶，無上指引是僧寶。」

在不共的密乘「內皈依」中，以身、口、意三門供養上師，依止本尊修行，以空行為助伴，成就上師、本尊、空行三根本，以此皈依。

在殊勝善巧的金剛乘「密皈依」中，凈化脈、氣、明點，清凈脈而現化身，清凈氣而現報身，清凈明點而現法身，以密皈依成就法、報、化三身。

在究竟實相的金剛乘「極密皈依」中，皈依諸聖眾尊相續的本體空性、自性大光明，和周遍大悲等三相無別的智慧，以此不斷修持，使自己的自相續生起無相之智慧。

「真實善逝三寶三根本，脈氣明點清凈菩提心，體性自性大悲壇城中，乃至勝義菩提恆皈依。」這四句皈依文，包括了外、內、密及極密的皈依，具有「因皈依」和「果皈依」的意義。

在共同乘中，不論是小乘或是大乘，都是先從皈依佛、法、僧三寶開始修起。「皈依佛」的「佛」，分為法身、報身、和化身三身。法身是最究竟的，我們從最初的修行，一直到真正理解般若空性，證悟究竟法身佛的果位為止，都必須不間斷地依靠三寶，懺悔業障，累積資糧。這種皈依稱為「因皈依」。

有關皈依的修法，因修行的方式而有所不同，由皈依的對境，依次往「內」依止。對所有佛教徒來說，佛法僧三寶是因皈依的對境；在我們還沒有完全成就證悟之前，三寶始終是修行的對境所依。

在金剛乘里，並不強調以因找果的途徑，尋找心性本體，來成就果位，這是為什麼呢？因為法身本是內在心性的本體，不假外求，過去、現在、未來，始終無生無滅。於本體體性上，無任何舍取之心，也沒有任何好壞分別。我們依靠禪定和般若等各種修行方法，讓本具的佛性，也就是原始的覺性，從「客塵障」中自然透脫，安住在空性中，現證法身佛果位，並不是在心性外面，另外去尋找一個果位。這種直接對原始清凈的心性本體，本有的法身境界所作的皈依，稱之為「果皈依」。當然，這是非常難修的。

由於我們對佛、法、僧的虔誠，從「因皈依」開始，依靠三寶，透過佛、法、僧的慈悲力，慢慢修行，從無明愚痴中覺醒，自然會產生法喜的覺受。在修行過程中，雜念和分別心越來越少，對世俗種種的執著，也會慢慢消失，那時，會逐漸體解心性本體。如是精進，最後會恍然大悟，原來法身是人人本有的佛性。

但是，對現在正在修行或還沒修行的人來說，那清凈本有的佛性，無始以來，早已經被深厚無比的煩惱習氣所覆蓋，這就是所謂的「客塵障」。為什麼本有的清凈本性會被掩蓋呢？因為二元對立的分別心產生以後，由分別心形成眾多複雜的雜念和妄想，本性覺受的光明因此就被遮掩住了。為了要讓覺性光明顯現出來，最佳的捷徑，就是追本溯源，直接探究心性根本。對於所有二元對立的分別，包括內在我執和外境實有的執著，用「果皈依」的方式去破除，破除到最後，本性光明自然會顯現。

同樣是正法，因為修行的方法不同，往外依止和往內依止，兩者在速度上有快慢的差別。依賴外境，成就的速度比較緩慢；往內依止心性本體，成就的速度比較迅速。如果想要往內求，就要先從明白自己的種種心念開始，以「正知、正念」觀察自己的身口意，時時安住在原始清凈的本性中。要修到這樣究竟證悟的成就，中間需要不斷追隨具德上師聞思修佛法，並有百分百堅定不移的信心，所以，我們常說，修持密法需要上上根器的人。

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