邢立達等人發表 Nature，在琥珀中發現世界上最小的恐龍，有哪些意義？
emmm之前在微博說過了，這裡還是再說一下吧。之前給 @Congyu 點過贊（今天發現怎麼沒了？又點了下），今天也給 @孫天任 點了贊，然後就被一些朋友問了……
並不是說我完全贊同哪一方的觀點，相反，我認為既沒有站隊的必要，世上也不應該只有一種聲音。
當你看到了你不喜歡看的聲音，也不代表對方是被人收買的。
先貼一下微博發的觀點吧：
簡單來說，我對這件事的看法是：
1、學術質疑應當是合理的，不在於發聲平台；
2、科研圈的粉圈化是不應該的，絕對不能慣著。
當然，我發的這個也沒濺起什麼水花，但這也不重要，在能發聲的時候發出自己的聲音，對我來說就足夠。
回過頭來說說@孫天任 的回答里我不同意的地方：
1、發表在高水平期刊上的文章就默認可靠
經過了同行評議（peer review）的考驗，發表在高水平期刊上，就默認是經過科學共同體背書，是可靠的
一篇發表的文章，只能說是經過了1-3位reviewer和負責這篇文章的主編的考驗，在這之前科學共同體是不知道這個事的，也沒有理由默認這樣的文章是經過科學共同體背書的。恰恰相反，一篇文章發表出來之後，才開始正式接受整個科學共同體，尤其是同行的評價和質疑，而只有經過時間和質疑考驗的成果，才能說是由科學共同體背書的「主流觀點」。（當然，我並不是說主流觀點一定是對的，這是兩回事）
事實上，科研圈的人應該知道，越是頂刊，越是喜歡發有爭議性和話題性的文章，而且從某種角度來說不可靠的概率並不低。這裡沒有指責某個個人的意思，NS的文章在發表之後一段時間被發現是大烏龍的太常見了，這些正是來自科學共同體對真理的追求和不懈的質疑。
2、通過新媒體發表學術質疑不妥當
之前舉的兩個例子，都是在學術期刊上發表了質疑文章。而這次的質疑文章，卻是在論文剛發表、全網宣傳的階段就發到新媒體上，這很容易被理解成對網紅科學家的打壓。
其實原po的回答里也說了「像是《琥珀中的「史上最小恐龍」，也許是史上最大烏龍》這樣的標題，放在評論文章（comment）或者學術報告上毫無不妥，甚至可以想像台下的老師學生們嘻嘻哈哈，充滿了快樂的空氣。」學術圈裡應該知道，這種直接從標題摘要就開懟的comments或者學術文章並不少見，那麼本來毫無問題的標題，為什麼到了普通的社交媒體就有「不妥當」了呢？
因為粉圈文化里是不思考只站隊的：你不誇那就是黑就是打壓，你說了我不喜歡的話就是被收買了就是洗地。
可是，沒有問題的就是沒有問題，憑什麼去照顧粉圈呢？無理取鬧絕不能慣著。
再說說同意的地方：
科研文章里犯錯是很正常的，對文章內容的質疑不應上升到人身攻擊和挖墳揭黑歷史的地步，可以適度質疑，但沒有確鑿的證據不應該輕易指責對研究成果的誤讀背後一定指向有主觀道德問題。
（儘管我並不認為邢老師對這次質疑的處理態度是妥當的。）
最後一句話：如果你不希望學術圈粉圈化，那麼自己也不要一不留神走上不思考只站隊的邪路。
當然，這也只是我的觀點，你可以不同意。（這是-1句話，要嚴謹，嗯）
3.27更新
根據財新網報道（http://science.caixin.com/2020-03-26/101534172.html）在這項研究中，邢立達除了提供琥珀標本，並在論文里寫了琥珀的產地，重量這些內容之外就什麼東西都沒做。而做為分類學文章重頭的形態學描述和系統發育分析都是由晶梅寫的以及分析的。剩下兩個figure里所涉及的線性回歸以及形態空間分析都是由其他國外合作者收集數據並完成分析的。而至於CT掃描復原，邢立達甚至都沒有參與，全都是由黎剛的團隊完成的。可見，邢立達在這次研究中依然玩的是同樣的套路，從收藏者手上搞到標本，之後拿著標本跟其他專家簽霸王合同，自己什麼都不幹，最後要求掛一作。
3月19日更新。正式的質疑文章已出，頂孔（圖1g），翼骨齒（圖2），齶骨齒（圖1d），側生齒（圖1e和圖3），缺失方軛骨和眶前孔（圖1b）已經實錘
鏈接https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.16.993949v1
圖1
圖2
圖3
1.根據Xing等人的三維模型，這個標本沒有方軛骨，沒有眶前孔，有翼骨齒，側生齒和頂孔
2.更大的系統發育分析顯示，眼齒鳥屬於鱗龍類，現在已經一堆人在算了，主要的問題是它屬於鱗龍類的哪個部分
3.如果這只是鑒定錯誤，確實只是學術爭論，但是如果作者在文章發表前就被告知這是蜥蜴，或者持有該物種更完整的標本，這件事情就是明知故犯，就是學術造假。目前這關於這方面有古生物學家在社交平台上爆出相關聊天記錄
4.返樸的文章寫的通俗易通邏輯清楚，一針見血的切中論文的問題。我們在這裡的討論也都是基於這件標本本身，以及其它古生物學家對這項研究可能的存在的學術誠信問題的爆料。我不知道為什麼有些答主會把話題引向返樸那篇文章的題目，以及怪罪那些作者沒有走所謂正規的學術途徑。學術質疑可以發生在除學術期刊以外的多種平台上。現在指示眼齒鳥屬於鱗龍類的證據越來越多，也有其他古生物學家爆出了這種生物其它標本的照片，作者們接下來需要回應的是來自國際同行如潮水般的harsh comments。之後三維模型也會公布。
以下是一個大矩陣的系統發育分析
以下是義大利的一個古生物學家使用了包括鱗龍類和鳥類的矩陣進行的系統發育分析，雖然物種數量較少，但是加入鱗龍類以後就跑到那裡去了
3.12晚上更新。
琥珀中的「史上最小恐龍」，也許是史上最大烏龍?mp.weixin.qq.com
更多可疑細節參加這個鏈接，我僅僅提到了牙齒的奇怪還有對恐龍/鳥過於微小的體型，這篇北古所老師們寫的文章顯然更為全面。當然，這也是我見過的最快的......應該不久以後期刊會有正式的comment。
事實上，今天古脊椎圈子看到這篇論文已經炸了鍋，中國美國歐洲的朋友都和我交流了各自的看法。很多人直截了當告訴我這個標本是蜥蜴，但是作者「無論如何堅持要發表」，也許因為是一篇nature封面吧。
更有甚者，美國某高校的同仁送來了黑板畫，不得不說有兩把刷子
科學研究允許犯錯，允許論文里犯錯，允許頂刊論文犯錯。我這兩年在知乎，在科普講座，學術會議都犯了很多錯誤，感謝那些指出我錯誤的老師，同學和朋友。但是要把造假解釋成「犯錯」，虎兕出於柙，龜玉毀於櫝中，是誰之過與？
以下為原答案，寫於3.12上午
手機碼字
希望可以看到更清楚的標本細節，另外解釋清楚標本來源。
另外，我記得恐龍是槽生齒，也就是牙齒在牙槽中整個被包裹起來，而蜥蜴是端生齒，牙齒類似於貼在頜骨內側，具體看下圖。
看了一下論文里的圖，感覺很難排除蜥蜴的可能性。當然，如果是這個大小的蜥蜴，應該只能在其他刊物相遇了。圖在下面，大家自己判斷。
目前我覺得比較有趣的就是牙齒這一點，具體的論文細節討論，支持或者反對的聲音應該很快就會出來，拭目以待。
最後，再好的標本，如果沒有合理來源，研究是很危險的事情。一方面是原始信息的丟失，另一方面是存在不真實的可能性，最後買賣標本無疑是在muddy the water。血鑽，血鈷例子就在身邊，不希望看到血化石
我也來整個活
邢氏琥珀長頸鹿
邢氏眼螯蟹
回歸本行的邢氏直角石和邢氏近魷
琥珀中的「史上最小恐龍」，也許是史上最大烏龍
近年來，隨著科技出版數量激增，出版節奏加快，僅靠論文發表前的少數同行進行審稿，已無法完全保證論文的質量及可靠性。因此，論文出版後的同行評議、可重複性檢驗和相關學術交流正變得越來越重要。高質量的研究應當經得起時間的檢驗。
今天，我們收到了來自幾位古生物學研究者的署名文章，質疑中國古生物研究者邢立達及其合作者3月12日在Nature雜誌上以封面文章形式報道的「世界最小恐龍」，認為其並不屬於恐龍或鳥，而很可能是一件蜥蜴的頭骨。如果他們的質疑成立，這篇論文將是古生物學史上最大的烏龍事件之一。我們希望，這樣一次學術性的質疑、討論能促進學界的深入研究；我們也希望，大家能藉此機會，深入地思考該如何把關科技論文的質量，如何評價科研成果的質量。
撰文｜王 維（中國科學院地質與地球物理研究所）
李志恆（中國科學院古脊椎動物與古人類研究所）
胡 晗（澳大利亞新英格蘭大學）
王 敏（中國科學院古脊椎動物與古人類研究所）
易鴻宇（中國科學院古脊椎動物與古人類研究所）
盧 靜（中國科學院古脊椎動物與古人類研究所）
北京時間2020年3月12日，《自然》（Nature）雜誌以封面文章形式刊登了緬甸琥珀中的一項新發現：一件不到2厘米的頭骨[1]。文章作者邢立達等人將頭骨鑒定為鳥類，而且是一個全新的物種，他們將這個新物種命名為「眼齒鳥」（Oculudentavis）。因為鳥類是由恐龍的一個支系演化而來，所以廣義的恐龍包括鳥類。可見，眼齒鳥不僅是「世界上最小的鳥類」，也是「史上最小的恐龍」。論文揭示了恐龍中前所未有的極端「小型化」現象，以及「過去未知的身體藍圖」和「未知的生態（類型）」，可以說是一項很有趣的發現。
文章給人的第一印象是：這件頭骨標本保存得很好，並且X光掃描和重建也比較清晰，對於緬甸琥珀來說很難得。然而，讀完全文之後，我們卻產生了一連串的疑問。論文作者們對標本解剖特徵的解釋，能得出文章中的鑒定結論嗎？這個頭骨真的屬於鳥或者廣義的恐龍嗎？
推敲之後我們發現，論文斷定這件頭骨屬於鳥或廣義恐龍的證據並不過硬，甚至一些重要的解剖特徵更支持這件頭骨屬於某種蜥蜴。
如果這件化石不是鳥，也不是恐龍，那這項研究的一切結論，以及結論的外延、重要性和科學意義都將無從談起。
爬行動物演化關係
我們一般說的「爬行動物」早在約2.5億年前，就演化出兩大繁衍至今的分支，一支叫主龍類（archosaur），包括鱷類、翼龍、恐龍等。恐龍中的一支演化成鳥類，所以鳥類可說是一類特化的恐龍。另一支叫鱗龍類（lepidosaur），包括喙頭蜥、蜥蜴、蛇等。屬於主龍類的恐龍/鳥，和屬於鱗龍類的蜥蜴，不僅分家時間早，親緣關係很遠，而且在骨骼的很多方面，尤其是頭骨形態上，都存在顯著而穩定的差別。因為中生代的古生物化石無法提取DNA，這些細緻、獨立的骨骼形態特徵，就具有了重要的鑒定意義，是化石分類的決定性依據。
疑點 1頭的形狀能證明它是鳥嗎？
首先來看看，作者是用什麼證據鏈來支持這件標本是鳥的呢？實際上，在整篇論文中，討論標本為什麼被歸到鳥/恐龍的篇幅極其有限，與其重要性並不相符。論文中唯一的陳述是：「眼齒鳥的頭骨整體展現出鳥類頭骨的形態，包括窄長而尖的吻部、後移的鼻孔、增大且輪廓清晰的眼窩、縮短的眶後區域，以及圓頂狀的頭頂。」可見，作者是根據「頭型」——即連續的幾何形狀，而不是離散的解剖學特徵——將這件標本鑒定為鳥類的。
可是，這些形狀，在爬行動物中並非只有鳥才有。趨同演化現象很常見：親緣關係迥異的不同動物，經常會演化出非常接近的外形。蜥蜴中的鏟吻蜥（Meroles anchietae）、安樂蜥類（例如Anolis dissimilis），吻部都有不同程度的加長；主龍類中的Avicranium renestoi[2]和Teraterpetonhrynewichorum[3]，這些和鳥類/恐龍親緣關係甚遠的爬行動物，也有嘴尖而長、鼻孔後移、大眼等頭型，因此，僅僅基於這些連續形狀的相似性，無法得出標本屬於鳥/恐龍的結論，繼而無法演繹出一系列後續意義，何況還有一些重要的解剖特徵指示著這件標本屬於蜥蜴的可能性。
整體外形的趨同演化
生物形態學研究的首要原則是：基於解剖學特徵，而不是整體外形的相似性，來推斷生物間的演化關係。由於在類似的自然選擇壓力下，親緣關係很遠的生物，也經常會演化出相似的外形，這一現象稱為趨同演化。例如鯊魚、魚龍、海豚，分別屬於魚類、爬行動物、哺乳動物，但由於都適應于海洋中的生活，善於游泳，而演化出了同樣窄長的吻部、流線型身體、鰭狀肢和鰭狀尾，但各自的內部解剖特徵卻千差萬別。再例如，人類和大熊貓的手掌，都有一個可以握住竹竿的大拇指，人類的大拇指是真正的大拇指，而熊貓的「大拇指」卻是加長的腕骨。所以，使用形態學數據推斷演化關係和分類位置時，離散的、不容易發生趨同和反轉演化的解剖學特徵，多數情況下要比複合的、容易發生趨同和反覆變化的整體外形有更大的分類意義。
疑點 2不合理的系統發育分析
系統發育分析，是將需要比較的物種及其形態特徵編碼構建成數據矩陣，利用統計學方法來計算各物種間的親緣關係，形成樹狀分支圖。論文的系統發育結果表明，眼齒「鳥」是一種非常原始的鳥類，剛剛從恐龍家族中分化出來，僅次於始祖鳥（Archaeopteryx），是目前「第二原始」的鳥類，它之後是熱河鳥（Jeholornis）。
問題在於，論文作者們計算眼齒「鳥」的系統位置時，只是將其放在一個樣本選取全部為鳥類的數據矩陣內運算，而沒有置於更大的範圍內，比如樣本包括恐龍、蜥蜴等其他爬行動物的代表。這意味著，在進行分析之前，作者就已經認定這件標本是鳥。如果這件標本有明顯的鳥類鑒別特徵，如此取樣尚可接受；但是這件標本不僅缺乏主要的鳥類鑒別特徵，而且還有一連串蜥蜴才有的特徵組合，這時再使用一個樣本全為鳥類的數據矩陣進行分析，等於不動聲色地、先驗地將這件標本歸到了鳥類，這在方法上是不合理的。
下面就來看看這件標本上組合了哪些解剖特徵，未見於鳥類或廣義恐龍，反而在支持它可能屬於蜥蜴？
疑點 3沒有眶前孔的鳥？
鳥類和恐龍在頭骨上有一個非常穩定而具有鑒別性的特徵，那就是眶前孔（antorbitalfenestra）。眶前孔在多數主龍類支系一直保留著，並被作為主龍類頭骨的一個重要的共有衍征，即使有極少數與其他孔癒合或閉合，也都留有痕迹。但是，正如論文作者們已經注意到的，琥珀頭骨上並沒有眶前孔1，也沒有眶前孔留下的任何痕迹。這非常奇怪，要知道，雖然從主龍類祖先演化到獸腳類恐龍，再演化到鳥類，以及鳥類後續的多樣化過程中，頭骨發生了不少巨大的改變，但眶前孔存在這一特徵卻一直非常穩定。
論文作者對這件標本完全缺失眶前孔是有解釋的：「因為頭骨小型化，導致眶前孔丟失。」[1]可是，這件標本既然大小和蜂鳥頭骨相仿，那蜂鳥的眶前孔是否也丟失或退化呢？事實上，各種蜂鳥的眶前孔全部都完完整整地保留著。可見，這種解釋不太站得住腳。
相比之下，所有的蜥蜴都沒有眶前孔。從這件標本沒有眶前孔來看，它不太可能是恐龍或鳥，反而可能是蜥蜴。
疑點 4長著側生齒的「鳥」？
許多熟悉爬行動物形態的讀者可能都知道，所有恐龍/鳥類的所有牙齒，都是長在頜骨齒槽里的「槽生齒」（thecodont）。而蜥蜴牙齒的著生方式則截然不同，是從頜骨的表面長出的「端生齒」（acrodont）或側表面長出的「側生齒」（pleurodont）。根據論文的圖及描述，這件化石中，上頜骨的牙齒顯然是側生齒，這種著生方式在蜥蜴中常見，但在恐龍和鳥類中是史無前例的。
疑點 5神秘的方軛骨
在眼眶的下後方有沒有方軛骨（quadratojugal），是蜥蜴和恐龍/鳥頭骨的又一大區別。已知所有恐龍和所有基幹類群的中生代鳥類都有方軛骨。在進步的今鳥類中，方軛骨在軛骨支末端癒合在了一起，而蜥蜴則完全沒有方軛骨。在論文頭骨線圖的側視圖上，作者們在這個位置隱約畫了一塊骨頭，但是卻沒有作出任何標註，更沒有說明這是方軛骨。不僅如此，在線圖的頂視圖、CT數據的重建中，這個位置看起來卻又不像有方軛骨，作者也仍舊沒有作出任何標註，甚至論文全文及附件竟然都對方軛骨隻字未提。
方軛骨的存在與否對標本的分類歸屬至關重要，因此，論文不提方軛骨的做法簡直是不可思議。作者畫的這塊骨頭到底存不存在？只有對標本或掃描數據進行進一步重建，這一謎團才能解開。如果方軛骨在標本中不存在，那又將再次證明這件頭骨不是鳥/恐龍的頭骨。
疑點 6蜥蜴才有的鞏膜骨
論文中這件琥珀頭骨的鞏膜環保存得很好。鞏膜環是很多爬行動物眼睛中的一圈骨片，起到加固眼球、保持眼球形狀的作用。這些骨片稱為鞏膜骨。恐龍和鳥也有鞏膜環，但每一片鞏膜骨的形狀都很簡單。在這件琥珀頭骨中，每片鞏膜骨中段縮窄，整體呈勺狀——這種形狀相當有鑒別性，只在蜥蜴中發現過，在恐龍和鳥類中從沒有過。論文作者在原文中也提到了這一點。
疑點 7史上牙齒最多的「鳥」？
論文中這件琥珀頭骨上的牙齒異常多（僅上頜右側就有23顆），超過了目前已知所有的鳥類。現生鳥類牙齒已完全丟失，即使在古鳥類中，牙齒大多也已經退化到很少。
那標本會不會是獸腳類恐龍呢？在這件琥珀頭骨上，齒列延伸得很靠後，最後面有4顆牙都長到了眼眶下方，這在幾乎所有古鳥類和獸腳類恐龍里，都沒有出現過。
魚鳥（Ichthyornis）是已知牙齒最多的鳥，它單側也只有18/20顆5，上頜齒列止於眼眶前緣。而且，魚鳥較多的牙齒與次生的食魚習性有關。這件琥珀標本如此微小，恐怕不會主要食魚。
但是，牙齒較多，以及齒列明顯延伸到眼眶下方，這兩個特徵的組合在蜥蜴中是很常見的。
以上幾個與蜥蜴有關的重要解剖學特徵均不支持這件標本為鳥類或恐龍類。除此之外，還有一些生物學一般認識上的明顯疑點。
疑點 8體型大小
論文的主要「賣點」之一是琥珀頭骨的大小。這件並非幼體的頭骨除去吻部，長度是7.1mm，差不多只有綠豆大小，一旦確定是恐龍（或者鳥），就是世界上已知的最小的恐龍（或者鳥）。但是，跳出來想，這恰恰說明標本的大小對恐龍或鳥來說不合常理，或至少是極為罕見的。而如果這件琥珀頭骨是蜥蜴，那這個大小就完全合理了。論文中提到Lacerta屬的蜥蜴，其鞏膜骨形態與琥珀標本相似，而且頭骨大小也和這件琥珀頭骨相近。而且世界上還有更小的蜥蜴，比如現生的侏儒變色龍（Bradypodion），不同個體的頭骨只有4.5mm到6.4mm長[6]，比這件琥珀頭骨更小。
疑點 9沒有羽毛？
目前報道的所有含有鳥類或者恐龍的緬甸琥珀里，都不同程度保存了羽毛。論文里這枚琥珀的內含物保存極好，可奇怪的是，這枚「鳥頭」上卻找不到絲毫羽毛的痕迹。相反，仔細觀察論文提供的琥珀照片，在頭骨後部發現有一些明顯有鱗片紋理的物體。當然，這並不能說這些鱗片紋理屬於這個動物，而且沒有羽毛保存，也並不能說明這件標本一定不是鳥，因為頭骨可能是白骨化後才被包裹進琥珀的。但無疑，沒有羽毛，就等於缺失了支持這件標本是鳥的決定性證據。
我們注意到，作者在論文中用了不少模稜兩可的詞。例如，摘要里只用了「bird-like」（像鳥的），而沒有斬釘截鐵的說是「bird」。正文中作者又說，這個頭骨與所有鳥類、甚至所有恐龍都太不一樣了。再例如，論文最後總結說：鑒於眼齒鳥的異常形態（顯然與其他所有鳥都不一樣），新的發現極其可能改變現有的分類結果。
我們並不清楚，這是否意味著論文作者自己也不確定這件標本是鳥/恐龍，還是蜥蜴？
如果是這樣，作者卻僅僅很含糊地提到了「分類的不確定性」，似乎他們只是不確定這件標本究竟屬於鳥還是恐龍，因為在演繹標本的重要性和科學意義時，作者們仍然完全只考慮了該標本屬於恐龍/鳥的論斷。
同時，耐人尋味的是，儘管作者在論文中已經提到了標本所具有的一系列解剖特徵，而且這些特徵只有蜥蜴才有，在所有已知恐龍/鳥中找不到，但他們卻通篇完全沒有提出一丁點這件標本屬於蜥蜴的可能性。
這裡的致命問題在於，這件標本之所以能發表在《自然》雜誌上，其重要性全都建立在標本屬於鳥/恐龍的論斷之上——從文章題目「Hummingbird-sized dinosaur」（「蜂鳥大小的恐龍」）便可知。可惜，如上所述，目前的科學證據遠不足以將這件標本歸到鳥或恐龍中。而且，標本反而擁有一系列蜥蜴的鑒定特徵，或叫共有衍征。
假若這件標本只是一種形態奇特的蜥蜴，那它就只是一個比較普通的發現了。蜥蜴的多樣性從中生代一直到現在都很高，這件標本非但不是世界最小的蜥蜴，也不能斷定它是蜥蜴中「未知的身體藍圖」或「新的生態類型」，並且緬甸琥珀中也已經報道過大量保存很好的小型蜥蜴[7,8]。一旦證明這件標本不是鳥/恐龍，這篇論文的研究水準，乃至這件標本的科學意義，就遠無法達到《自然》或其他高影響力期刊的要求了。
後續建議
化石發現是古生物學的魅力之一。正因如此，當新的化石材料帶來奇特的新形態時，需要「有一分證據說一分話」，謹慎地進行比較鑒別，儘可能全面地考慮各種解釋的可能性及相應的意義。可是，這篇《自然》封面論文的作者卻在缺少可靠證據的情況下，將一件擁有大量蜥蜴鑒定特徵的琥珀頭骨武斷地鑒定為恐龍/鳥，導致論文的整個證據鏈斷裂，隨之演繹出的重要性和科學意義便無從談起了。
我們希望論文作者對上述質疑儘快作出公開回應。同時也希望論文作者迅速公開CT掃描原始數據，讓其他科學家也能根據原始數據對現有的結果進行可重複性驗證。我們將通過學術渠道作進一步評述。
參考文獻
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