大蛇丸本體和天之咒印之間究竟是什麼樣的關係？
最常見的說法是大蛇丸在種下天之咒印的時候分裂了自己的一部分靈魂（有點類似伏地魔的魂器），如果是這樣的話，有幾個疑問：
1.大蛇丸本體和天之咒印之間能否互相交流、傳遞信息？大蛇丸本體能否直接控制天之咒印？
2.一個天之咒印裏的大蛇丸靈魂是否可以直接遠距離「穿越」到另一個天之咒印裏？如果不是的話，那在忍界大戰時期復活的大蛇丸還是「完整」的嗎？如果有兩個種植了天之咒印的人，那理論上是不是可以「克隆」兩個大蛇丸出來？
3.紅豆身上的天之咒印是在大蛇丸本體雙手靈魂被封印之前就種下的，為什麼通過紅豆咒印復活的大蛇丸仍然需要解開屍鬼封盡來恢復雙手？難道在大蛇丸本體中招時，天之咒印裏的雙手部分靈魂也一起被封印了？
4.另外，被鼬的十拳劍封印的靈魂最終去了哪裡？是被鼬扯進了自己的身體嗎？穢土鼬的十拳劍葫蘆裏有生前封印的靈魂嗎？直接對活人使用十拳劍會有怎樣的效果？
遇事不決 量子力學。量子糾纏瞭解一下？（手動滑稽）
信息的問題可以參考影分身。
比如，影分身消失時，信息是以何種方式回歸本體的？
再者咒印是寄宿在紅豆身上的，可能紅豆知道什麼，他就知道什麼。所以，復活的大蛇丸才說：他從紅豆身上看到xxxxx。
而且，復活後的大蛇丸還從兜的身上回歸了一些查克拉，兜當時知道什麼，大蛇丸就知道什麼。
因此，信息的事情不難理解與接受。
大蛇丸，能不能控制「天之咒印」的人？
我認為，此處的咒印更多的是一種侵蝕精神。更多的輔助的精神控制系。如果此人並沒有完全被咒印佔領意志，那麼最多也就是分神僵直的效果。
能不能復活兩個大蛇丸？
很可能是那種，本體喪失活性後備份才開始運轉，並且同一時刻最多工作一個備份的機智。
關鍵的，為什麼從紅豆處復活的大蛇丸還需要解開屍鬼封盡的兩條手臂？
我認為，除了參考影分身的原理，還需要追加一個屍鬼封盡特殊性的設定。
影分身這個術：分身受到的傷害並不會傳遞給本體，但是本體受到的嚴重傷害是會影響到分神的。
到了大蛇丸這裡就是，某一個天之咒印的寄宿體死掉了，並不會影響大蛇丸本身。但是大蛇丸如果本身受到嚴重傷害，則會嚴重影響到天之咒印上的靈魂碎片。
這時就要追加屍鬼封盡的特殊性的設定了。
假如，咒印和本體間的信息傳遞是利用方式A實現的。屍鬼封盡的特殊性就在於，當它封印本體的靈魂時能透過方式A實現這種逆追蹤。也就是說：本體的靈魂因屍鬼封盡而缺少了什麼，咒印上的靈魂也就缺少了什麼。
因此復活後的大蛇丸才需要去解開封印。
屍鬼封盡直接作用於靈魂。而像砂隱村的布傅術更多的是將靈魂限制在祭品肉體的軀殼裡。舉個不恰當的例子，布傅術就是在身體上施加了一個結界，限制身體的活動。
最後，我認為：十拳劍的封印是講靈魂+肉體一併封印的。也就是說，它封印活人和封印穢土轉生的人效果一樣。
至於，被封印的人去了哪？自然就在那葫蘆裏。不管是鼬還是穢土鼬，封印的傢伙都是在同一個葫蘆裏。就是鼬用特殊手法召喚出來的，類似於屍鬼封盡時召喚出的死神。只不過鼬是用萬花筒寫輪眼的方式。
所以那些人並不是被封印在鼬的眼睛裡，或者鼬的身體裏，只是在葫蘆裏而已。
當然，如果劇情需要，鼬的眼睛是進入葫蘆的一個窗口，我個人也完全接受這種腦洞。
你問的，剛好是火影諸多bug裏的一個
目前並不確定天之咒印和大蛇丸本體之間的關聯性如何，因為一部分設定是相互矛盾的
1、大蛇丸復活後提到：天之咒印中包含其意識（將重吾的體液（具備自然吸收自然能量的特性，解除了仙術查克拉的靜坐要求）和大蛇丸的仙術查克拉混合，種植在目標身上），並且在很長一段時間內，大蛇丸透過紅豆的咒印在瞭解外界。最神奇的一點是：待在紅豆體內，完全沒見過屍鬼封盡，結果會解除屍鬼封盡。
2、大蛇丸依然需要解除屍鬼封盡讓靈魂完整
3、佐助在第一部終結谷一戰中，露出過大蛇丸的蛇眼
依據1，代表：天之咒印可以認為是一個大蛇丸的分身，擁有獨立思考的意志，只要在特定情況下，就可以藉助肉體復活。
依據2，代表：大蛇丸的靈魂並不完整，需要解除屍鬼封盡來讓自己完整；
依據3：代表：大蛇丸的意識可以在其本體仍然存活的情況下，直接在天之咒印附身者身上體現出來。
1+2：代表本體和天之咒印不是完整意義上的獨立存在。靈魂的完整性與咒印之間沒有關聯，但信息可以共享。
1+3：代表本體和天之咒印可以獨立存在，咒印本身就是大蛇丸獨立出去的意識。相互之間可以共享信息
2+3：大蛇丸的精神是可以分裂存在，但靈魂共享
這3個混在一起的結果：相互矛盾。除非靈魂和意志是相互獨立的，然而並沒有解釋過這個
因而目前，能夠腦補的結果是：
天之咒印和影分身類似，個體之間有單獨的意識，而且信息可以相互傳遞（只不過影分身必須通過解除自身才能傳遞）。而靈魂則是不可分割的存在。
基於這個，對你的問題的答案就是：
1、可以相互交流，但本體對天之咒印是否有約束力不得而知。畢竟幾乎沒有同時存在過
2、靈魂作為一個整體，當大蛇丸死亡時，激活任意一個天之咒印，大蛇丸就可以藉助那個復活。但在本體存在時，激活天之咒印會有什麼結果，不得而知。無靈魂但有意識代表什麼，火影沒解釋過
3、本體消亡，紅豆的天之咒印激活下，靈魂從封印中出來進入咒印中復活。而為了使得靈魂完整，需要解除屍鬼封盡。
4、十拳劍封印的是本體的意識+靈魂。只能假設：靈魂必須通過意識才能變成真正意義上的自己。咒印激活後，紅豆這邊的大蛇丸意識把被封印的本體的靈魂重新呼喚過來了。把本體的意識丟在鼬的須佐葫蘆裏了。
你可以簡單理解就是大蛇丸的靈魂就像是雲伺服器裏的數據，咒印就像是電腦軟體。大蛇丸在好幾個電腦上都下載了軟體。
佐助率先卸載了大蛇丸的主電腦。
大蛇丸在佐助電腦裏也存了一個軟體，趁佐助不注意通過雲傳輸數據。數據剛傳輸完被鼬發現了，又把佐助電腦上的軟體卸載了。
然後佐助覺得大蛇丸的數據還有用，就登錄了紅豆的電腦，紅豆的電腦上也有大蛇丸的軟體，就又把大蛇丸的數據下載了回來。
當然這個並沒有實際的證據來證明這個觀點。
然後關於你的第二個問題，就是大蛇丸穿越的問題。
這個實際上是可以實現的，而且也是擁有已經實現了的例子的。
實際上這個會連同你後面的問題一起回答。
在漫畫中大蛇丸被鼬封印掉了，但是大蛇丸的靈魂實際上並沒有被封印掉。
這逃走的小蛇的體內實際上就是大蛇丸的靈魂，雖然小蛇被天照燒死了，但是大蛇丸的靈魂並沒有被消滅，因為天照不具有消滅靈魂的能力只能消滅肉體。
而影分身解除後查克拉會返回本體，加藤斷的靈化之術解除後，靈魂會回到自己的身體裡邊，那麼問題是影分身的查克拉，究竟是怎麼找到本體的所在的？
漫畫中有一個說法叫做查克拉共鳴，而這個說法實際上就和量子糾纏差不多，本體出問題，或者死掉之後，距離千里之外的影分身也會瞬時煙消雲散。
所以大蛇丸的靈魂完全可以利用這種查克拉的共鳴來確定自己咒印裏包含的查克拉。
雖然兜移植了大蛇丸的細胞，但是實際上他身上的大蛇丸查克拉還不如紅豆咒印裏的查克拉量來的大，所以要壓制再不斬的意識的時候，還是使用了紅豆體內的查克拉。
大蛇丸之的靈魂之所以選擇隱藏在紅豆的咒印中，而不是到都的身體內，佔據兜的身體，很可能就是想到佐助如果想知道真像的話，必然要讓自己穢土轉生歷代影，那麼必然要復活自己。
而直接佔據兜的身體雖然也是個選擇，但是在解除屍鬼封盡的時候，兜就死翹翹了。
另外，兜對於自身經過了各種各樣的改造，所以雖然有查克拉的共鳴，但是兜身上八九個人的查克拉混雜在一起，大蛇丸沒有分辨出來那是移植了自己細胞的兜也是很有可能的。
實際上這個的可能性更大。
就連香膦那樣高超的感知忍者都無法感知出來兜身上有大蛇丸的查克拉，那麼根本不是感知忍者的大蛇丸，感知不到兜身上自己的查克拉，可以說是理所當然的。
反而是紅豆的咒印中擁有大量的大蛇丸查克拉，而且這個咒印本身和大蛇丸的意識是可以直接的共鳴的，所以大蛇丸某種程度上可以控制咒印，那麼大蛇丸的靈魂定位了自己的查克拉所在，也就是紅豆，從而潛入了紅豆的咒印中也可以說是理所當然的。
也就是說，大蛇丸自始至終都只有一個靈魂，雖然紅豆身上的咒印是大蛇丸很早就施加的，但是那個裡邊只有大蛇丸的查克拉以及大蛇丸的意識，並不具有大蛇丸的靈魂。
雖然瀉藥
但是問的都是AB沒說明白的事，我也只能看著回答，題主也是看看就好。。。。。
要說大蛇丸和咒印沒關係那不可能，但是也沒有想像中的那麼大。
關係的話，我是這麼理解的（術語可能不對，就大概理解一下），
打個比方，忍者都是黑客，而大蛇丸是高級黑客，重吾是擁有病毒源碼但是不能高效利用，
大蛇丸的研究就是把這段源碼編程為一長串病毒數據流（即一股查克拉），為了進一步利用病毒，這股數據流的源碼大蛇丸的電腦這裡肯定有一份（也就是說大蛇丸自己有被重吾的查克拉改造，但並不強烈，僅達到可借用，不排斥的程度），然後通過接入其他終端傳輸病毒，表現形式為插入後臺啟動的應用程序（給予平時不發作的咒印）。
（被感染的黑客）被給予咒印者如果無法控制數據流解析源碼，那就自身難保，直接被黑掉（GG），如果能夠控制，那麼就黑客自身就能一定限度的利用這個病毒去增強自身實力，但是如果太過放縱的使用病毒，他畢竟還是病毒，黑客自身還是會GG。
而大蛇丸作為高級黑客的nb之處就在於，作為入侵者，大蛇丸可以在病毒數據流裏摻入自己的後門程序，但是使用者甚至查不到入侵者的IP地址。
也就是說，查克拉作為靈魂和能量的承載工具，在入侵了別人之後，大蛇丸可以通過查克拉上附著的意識對被入侵者進行一定程度的掌握，就像黑客把別人黑了就可以知道被入侵者的IP地址，然後窺屏，但是使用者本身不知道，啟用這個程序（開咒印）之後大蛇丸可以感知到。可以說這種方式比影分身高級一點，後者只能等數據迴流才能瞭解情況。
那麼當大蛇丸的終端遭到攻擊時無法使用怎麼辦呢？這時候作為入侵者的好處就在於被入侵者的IP地址大蛇丸知道，而且留有後臺程序，那麼他就可以以一定代價（損傷本體靈魂）的條件，乾乾淨淨的從原來的終端（身體）脫離，作為一定量（不是所有）的數據流傳輸到被入侵者的IP中，藉由咒印反噬被入侵者（搶奪查克拉）來再造自己。
所以總結來說，大蛇丸是咒印查克拉的利用者（既不是掌控者也不是主要使用者），通過這種特殊媒介對他人進行一定的有限的感知（這個我個人觀點），可能只有用了咒印纔有更高程度感知的機會。因為這種用法的查克拉上附著意識纔可操控（不像搓丸子那樣需要穩定物理狀態），所以傳了咒印，裡面肯定有大蛇丸自己的意識。
然後就是下面四個問題，我就按序號回答了（被入侵者我直接寫佐助了）：
1.不能交流交換信息，或者說佐助這邊完全不行，大蛇丸這端也僅僅可以感知到查克拉量這種基礎信息。如果能交換信息，大蛇丸完全可以肆意玩弄佐助，給予心理壓力，而佐助會一點辦法都沒有，基於大蛇丸想侵佔佐助的強烈慾望和他行為上佐助虛弱前一點動靜也沒有的反差，我覺得答案是不行。
2.第一小問回答是不可以。這個同影分身和心轉身，而且強制性更強。前二者必須在結束忍術效果後才能讓意識信息迴流，咒印的霸道程度可能是強行讓大蛇丸的這部分靈魂在咒印消失之前都回不去，而且前面我有提到，大蛇丸對天咒印的掌控程度並沒有那麼高，種下咒印後的A和B體內的靈魂是不能互相傳輸和轉換的，唯一方法可能是實體剝離，也就是大蛇丸本人去把A的咒印取消掉，比如再咬一口，這樣才能做到靈魂傳輸。被入侵者之間的轉換傳輸是不可能的，所以第二問的回答是不完整的也很顯而易見了。第三小問我不確定，但我個人是覺得有可能的，只是會是比較殘缺的大蛇丸（相比現在的殘缺的大蛇丸來說）
3.我這麼理解的，還是那我黑客的那個例子，死神就好比是國家安全局級別的網警，大蛇丸被日斬告到國家級層面了（指施術的巨大代價），那死神就能直接鎖定日斬提供的IP地址。因為級別差距甚至可以說是位面差距了，死神的契約（屍鬼封盡）強度大於一切生者世界的忍術，所以直接進行永久性的封禁，封掉一切和大蛇丸有關的IP，除非他能給死神提供別的好處（代價），那麼你的封禁才能被取消，或者說替換到別的東西上面。所以，大蛇丸如果不用別的東西再次使用屍鬼封禁來解禁，他的手這輩子都回不來。死神可以允許一般的現象苟存於世，以為他管不過來，但是你把我召過來讓我看那我不能當沒看見，所以大蛇丸轉生沒問題，想靠轉生解禁不行，人間之術脫不了神的刑罰。
4.另外，被鼬的十拳劍封印的靈魂最終去了哪裡？是被鼬扯進了自己的身體嗎？穢土鼬的十拳劍葫蘆裏有生前封印的靈魂嗎？直接對活人使用十拳劍會有怎樣的效果？
這個是bug，你可以理解為大蛇丸的主體靈魂被封在了十拳劍的空間裏，當然不在鼬的身體裏，十拳劍自帶一個幻術世界，靈魂會被封在那裡，估計靈器不毀，靈魂就不能解放。那麼第三小問就不是什麼問題了，靈器自身的能力和使用者死沒死沒關係，這方面就和天天用芭蕉扇一樣，能力就在靈器自身，誰用無所謂。
最後一小問的話，兩種可能，第一種大概會變成無限月讀那種乾屍？如果說人的生命能量是通過查克拉顯現出來的，而且靈魂也寄存在查克拉中的話，十拳劍可能會把查克拉也抽出來，就像大蛇丸那樣，從佐助身上出來的時候是查克拉，被劍吸走的時候直接融化全進去了；還有一種可能會向人間道抽走靜音靈魂那樣，只抽靈魂，身體保持原樣但是無意識。
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