1.實時定量pcr引物務必要保證擴增效率,就是說每次擴增都是與理論值偏差不多的2倍擴增。所以正式實驗之前最好做引物效率測試,即以已知濃度稀釋樣品,觀察定量值是否與理論值相同。在這方面要考慮引物本身的GC含量,PCR擴增片段的GC含量。此外,還要考慮擴增位置在cDNA上是否離polyA尾太遠,造成結果不穩定。考慮RNA不同剪切方式等等~~考慮off target,當然一般的off target都是可以通過溶解曲線看出來的,設計之前別忘了blast一下~~

2.我想你說的半定量是最後定條帶亮度吧,那麼你是沒有辦法精確確定引物擴增效率的。

具體取捨要根據你的實驗目的來哦~~~


當然不同了。real-time引物短,一般100-200 bp左右,太長很浪費;普通PCR一般要在400多,太短容易和dimer分不開。具體設計要求也有差別,一般real-time引物設計都是通過軟體進行的,普通引物要求比較低。


好像沒有


沒做過半定量,一般熒光定量PCR測轉錄,都是相對定量,絕對定量需要有已知濃度的標準品。做基因合成和測轉錄引物不一樣,定量半定量應該沒區別,區別在於你是不是有標準曲線


一般來說沒啥太大區別。

我們一般選擇會選擇特異性較高的一對引物進行試驗


RT—PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)是將RNA的反轉錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈式擴增(PCR)相結合的技術。首先經BIOG反轉錄酶的作用,從RNA合成cDNA,再以cDNA為模板,在DNA聚合酶作用下擴增合成目的片段。RT—PCR技術靈敏而且用途廣泛,可用於檢測細胞中基因表達水平、細胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。作為模板的RNA可以是總RNA、mRNA或體外轉錄的RNA產物。無論使用何種RNA,關鍵是確保RNA中無RNA酶和基因組DNA的污染。用於反轉錄的引物可視實驗的具體情況選擇隨機引物、Oligo dT及基因特異性引物中的一種。對於短的不具有髮夾結構的真核細胞mRNA,3種都可。


一般qpcr和半定量pcr的引物是同一個。用引物先跑半定量確定一下基因的表達是上調還是下調,然後才能跑qpcr來確定基因的更準確的表達量


和半定量的引物沒有啥區別


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