提肝臟RNA最常見的就是降解。看這個條帶有彌散,說明被降解了。如果題主用的電泳液是新的,膠是新的,電泳時間也沒有很長的話,有可能本身樣品就已經降解了,即使濃度和吸光度正常。


Marker 感覺沒什麼問題,如果覺得彌散可以減少量,另外要更換新的電泳液。

至於樣品彌散過於嚴重,如果濃度不是太高的話,或許有雜質和降解,建議更換儀器按照protocol重新提取樣品。但也可能是膠濃度過高導致。


Rna 電泳不出條帶有可能是rna已經降解了。因為rna是單鏈,很容易降解。


因為RNA很容易被RNA酶降解,而RNA酶存在十分普遍。

建議需要跑瓊脂糖凝膠電泳看RNA時,TAE緩衝液還有電泳槽,都經過高壓滅菌除酶後在進行,確保RNA不被降解


從左數第五個lane看起來最合理(ladder算第一個lane)。

第三個lane是因為有大量降解,把膠上的dye都吸收了,裡面就有黑色空洞。你上樣量降一降,可以把原sample稀釋一下試試。


明顯是降解了。

不過降解發生在哪個環節這個就比較難回答了,

1、組織本身降解:處理不當,反覆凍融。

2、抽提的過程:有沒用全新的kit和EP管,操作過程是否規範?

3、電泳的過程:電泳用的所有東西是否處理過?


有可能是提取時樣品量太大了,不要往RNA提取試劑里加太多液氮研磨的肝組織樣品,因為一般來說RNA提取試劑一般加1ml ,這時如果加太多樣品的話,1ml的RNA提取試劑抑制不了過多的樣品中所含有的RNA酶,所以RNA在提取過程中就會降解。

這是我們實驗室提取的結果。


很有可能是你跑膠的時候,用的loading buffer 不適合,我遇到過一樣的問題,看我寫的這篇文章https://zhuanlan.zhihu.com/p/133185051


推薦閱讀:
相關文章