唐朝建立以後，李世民對自己的父親李淵說，太子和齊王有陰謀，這種陰謀對你不利，對國家也不利。李淵在聽了秦王李世民的告密後，便開始準備處理李元吉和李建成了。在聽了李世民告密的第二天，李淵就召見太子和齊王，李淵說要和這兩個兒子聊一聊。李世民的告密，李淵是不能不重視的，其實喝茶聊天，就是想看看他們有什麼陰謀。

　　李建成清楚父親要對他動手了，所以李建成決定先進入皇宮，讓父親給自己一個交代。然而，就在李建成爲自己的陰謀鋪路時，半路殺出一個李世民。在向鬼門關邁進的李建成，根本不知道前面有什麼事情發生。所以，李建成順理成章的成爲了刀下冤魂。

　　這件事情之後，李世民好好犒賞了一下幫助自己策劃這件事情的兄弟。然而，這件事中，我們一直都沒有看見秦瓊這位戰神的影子。秦瓊在跟隨李世民四處征戰的過程中，秦瓊總能夠身先士卒，一馬當先，而玄武門這樣重大的事件，秦瓊這個猛將爲什麼不參加呢？難道這時候李世民已經不信任秦瓊了嗎？並不是，因爲即便沒有參與進來，李世民也是非常喜歡秦瓊的，還將他列爲了二十四功臣的行列，可見秦瓊是深受李世民器重的。那秦瓊爲何不參與玄武門事變呢？其實這和秦瓊本人性格是有一定關係的。

　　我們可以想想，作爲李世民最器重的大臣之一，在這種關鍵時刻不站出來，秦瓊的內心也是充滿糾結的。秦瓊雖然是一個武將，但是他還是一個傳統的武將，在自己的知識體系中，秦瓊對殺太子這件事情是不贊同的，太子被李世民罷黜，這不符合秦瓊的信仰。所以，在這件事中，秦瓊做了選擇，他要維護自己的信仰，要保持一位傳統士大夫兼武將的情懷，往不好了說，他不願意和殺太子的人“同流合污”。而後來史學界對秦瓊的評價也說明了秦瓊這種獨立思考的情懷。

　　有人評價秦瓊，說他是社稷重臣，他是良臣，也是忠臣，他忠誠的是自己的國家，而不是一個人。李世民作爲一代名君，他是深知秦瓊這種情懷的，所以，即使沒有參與，李世民依舊對秦瓊非常欣賞，或許君臣的這種心有靈犀，也是秦瓊不參與玄武門事變的重要原因之一吧。