在小皇帝萬曆當政的前幾年，始終有三座大山壓在他的身上，就像三團巨大的陰影，陰森森地籠罩在小萬曆的周圍，揮之不去，陰魂不散。這三座大山就是，萬曆的母親李太后，內閣首輔張居正，司禮監掌印太監馮保。張居正死去以後，萬曆帝開始獨攬大權，他早已經對馮保很痛恨。他痛恨馮保的直接原因，是馮保在小萬曆當皇帝的前幾年裏，爲李太后監視萬曆。

　　張居正做內閣首輔時，首輔權力達到頂峯，而張這個人，也素來被褒貶不一。首先，作爲內閣首輔，他所作所爲可以說完全是爲了大明王朝，改革新政，爲開始出現頹勢的明王朝續命，他的改革未能徹底，只能算是縫縫補補，讓明王朝得以延續。他本人勸誡要求皇帝節儉勤政，但是他本人卻又窮奢極欲，據說他做的轎子需要六十四個人擡，內置衛生間，廚房，臥室。

　　萬曆十年(1582年)，張居正病逝，親政的萬曆皇帝開始清算張居正，削去了張居正所有的爵位，並且抄家，朝中文武百官，張居正的下屬見到皇帝發飆，紛紛轉過身來反咬張居正一口，彈劾張居正擅權不法，欺君罔上，收受賄賂，罪惡滔天。

　　在朱翊鈞絕情要抄了張居正的家時，其實是有很多人爲張居正求情的，只是利令智昏、忘恩負義、權欲膨脹的朱翊鈞根本聽不進大臣們的意見。首先，李太后是反對抄家的。左都御史趙錦、吏部尚書楊巍、內閣輔臣許國、刑部尚書潘季馴等六部官員，都曾力勸朱翊鈞和丘橓對張居正及其家人手下留情。無奈朱翊鈞和丘橓報仇心切，根本不把羣臣和言官的奏疏書信放在眼裏。