秦瓊反隋，是由多方面因素造成的，而非某一單獨原因。既有家仇國恨，又有社會良知，並且是被逼而反。

秦瓊之父秦儀本是前朝南陳的臣子。楊堅楊素楊林等，平南陳滅北齊才建立大隋。秦瓊這類前陳遺孤，對大隋滅陳一直耿耿於懷，心在不滿，一有機會，比別人更易造反。更何況秦儀就死於楊林之手呢。

隋煬帝楊廣為六短之君，橫爭暴斂，窮兵黷武，致使生靈荼炭，民不聊生。各地起軍風起雲湧，秦瓊的朋友又多是綠林英雄，本就不服朝庭管，又有魏徵徐懋動的攛掇，秦瓊適反就成了早完之事。何況七煞反長安時，他姨夫長平王邱瑞還有一番言語的鼓惑呢。

為救程咬金尤俊達，秦瓊染面塗須詐登州，賈柳樓四十六友結拜，筷子令反山東，包疪截皇杠銀的響馬……其中任意一件，被官府知道都是滅門之罪，而以他的性格又不會不做，造反也就成了唯一出路

所以，既使楊林(楊林把乾女兒許配給了秦瓊，叫岳父也不算錯，另外秦瓊還是楊林的第十三太保，叫義父也行)不殺秦瓊之父秦儀，秦瓊也會造反。

注，提問者是按演義問的，這裡也是按演義答的，與歷史真實無關。