2009年11月23日，在菲南部馬京達瑙省安帕圖安鎮，包括省長候選人曼古達達圖家人、律師及32名記者在內共58人遭到選戰對手安帕圖安家族的私人武裝劫持並集體屠殺，震驚世界。這是菲律賓史上最惡劣的選舉暴力案件。

案發後，涉案的前馬京達瑙省省長安達爾·安帕圖安及其兒子相繼落網，共有197人遭到控告，但無人被定罪，所有被告均宣稱無罪。

11月28日，菲律賓司法部長阿格尼絲·德瓦納蒂拉27日對南部馬京達瑙省綁架屠殺案首要嫌疑人正式以謀殺罪提出指控。

她說，部分嫌疑人受良心譴責，站出來指控省長之子小安達爾·安帕圖安爲主謀。調查發現，這一案件中，警察、士兵和私人武裝以侮辱性方式槍殺女性。這些女受害者是否遭強姦還有待調查。

她當天早些時候對當地電視臺說，根據證人供詞，馬京達瑙省達都溫賽市市長小安達爾·安帕圖安指揮這場屠殺並親手開槍殺人。 “（他們得到的）命令是殺掉所有人^這看上去是有預謀的行動，”

一名目擊者說，“他（小安達爾·安帕圖安）就是下命令的人。”另一名目擊者看見小安達爾·安帕圖安親手開槍。 德瓦納蒂拉說，證人供認，參與屠殺的人中包括士兵、警察。 她說，包括小安達爾·安帕圖安父親在內的另外8名安帕圖安家族成員也被列爲嫌疑人。他們現在雖未遭拘捕，但菲律賓移民部門已經接到命令防止他們出逃。

小安達爾·安帕圖安

小安達爾·安帕圖安26日向當局主動歸案，同意配合調查但拒絕承認與這一案件有關。他眼下關押在首都馬尼拉國家調查局的看守所內。 他26日在看守所接受媒體短暫採訪時說，事發時自己在辦公，這起事件是菲律賓反政府武裝摩洛伊斯蘭解放陣線（摩伊）的一名首領溫布拉·卡託所策劃。“指責別人很容易，但必須要有證據。我是無辜的。案犯是溫布拉·卡託的摩洛伊斯蘭解放陣線的人，他們是恐怖分子。”

11月30日，大約有1000名包括記者在內的示威人羣在馬尼拉街頭遊行，抗議菲律賓南部11月23日發生的暴力流血事件，該事件造成57名平民死亡，其中至少30人是記者。

摩伊發言人也否認其組織與這一“野蠻行徑”有關，因爲他們根本不在事發地一帶活動。

屠殺事件發生後，多名當地警方高官已遭解職和調查，其中包括馬京達瑙省警察局局長阿武薩納·馬吉德。

菲律賓總統格洛麗亞·馬卡帕加爾·阿羅約的發言人當天說，阿羅約已經授命內政部長羅納爾多·普諾全權處理對當地軍政官員的調查，有權將馬京達瑙省和棉蘭老穆斯林自治區任何政府、警察和軍隊官員暫時停職。

曼谷達達圖27日在軍隊護送下前往首府向選舉委員會遞交競選材料。他的車隊由50多輛車組成，沿着與23日同樣的路線到達沙里夫阿瓜克。 “只有死亡能阻止我參加競選，”他對支持者說。

11月30日，菲律賓司法部長德法那德拉昨天表示，一名新的證人現身，並聲稱南部馬京達瑙省安帕圖恩家族的其他成員幫助策劃大屠殺事件。她說：“我們有一名證人可以證實，在這（大屠殺）發生之前，他在安帕圖恩家族成員下達指示（要如何執行大屠殺）的場所。”

她指出，新證人加強另外至少20名證人對安帕圖恩家族的指控。被指涉案者除了已經自首的馬京達瑙省拿督溫塞鎮長小安達爾·安帕圖恩外，還包括擔任回教棉蘭老自治區總督的扎爾迪·安帕圖恩和擔任馬京達瑙省長的家族長老，老安達爾·安帕圖恩。移民局已經把他們列入監視名單中，防止他們潛逃出境。德法那德拉說，小安帕圖恩直接指揮這次大屠殺案，暗示將對其他人提出更多控告。她說，提出控告的程序纔剛剛開始。

扎爾迪·安帕圖恩發表一份聲明，誓言要還大屠殺案遇害者公道，但堅稱他的家族無辜。他指控他們受到政治迫害，並指馬尼拉政府甚至阻止他的政治盟友向他伸出援手。

他說：“安帕圖恩家族受到圍攻。這是非法的迫害，迫害我們的人爲了挽救他們下挫的形象，正試圖利用這個事件。”不過他沒有指明迫害他們的人是誰。他表示，安帕圖恩家族聘請至少40名律師，爲小安帕圖恩辯護。律師團同時正在準備挑戰總統府要將他們停職的計劃。

菲律賓多名政府官員7日說，涉嫌製造政治屠殺案的安帕圖安家族武裝人員和菲律賓安全部隊6日晚發生交火。這是政府對馬京達瑙省實施軍管以來，當地發生的首起衝突。

截止2009年12月9日，菲律賓警方已確認有161人直接參與了馬京達瑙省政治屠殺案。 當天，菲律賓國家警察總長赫蘇斯·貝爾索薩在向全國進行直播的新聞發佈會上說，這161人大多是屠殺事件的首要犯罪嫌疑人、馬京達瑙省達都溫賽市市長小安達爾·安帕圖安的私人安全部隊成員，另有一些是當地的準軍事部隊人員，還有警察和軍人。

貝爾索薩說，這仍爲不完全統計數字，有報道說一些嫌疑人已加入在馬京達瑙省進行反叛活動的組織，菲律賓警方將提議對提供逮捕犯罪嫌疑人情報的人給予獎勵。

2010年3月25日，菲律賓法院發出逮捕令，指示警方加緊追捕涉及去年57人大屠殺案的196個嫌犯，遭逮捕令對付的也包括安帕圖安家族族長老安帕圖安。

這起發生在去年11月的大屠殺是菲律賓歷來最嚴重的政治暴力事件。一名候選人的7個家人、30個記者和20個平民被殺害。菲律賓軍警至今扣留了55名嫌犯，仍有142個嫌犯在逃。

刑事調查總警司蒙特內格羅說，在逃的嫌犯包括18名帕圖安家族成員和100多個槍手。 他說：“我們將繼續追捕他們和搜查可能被用來殺害那57人的武器。我們也在蒐集更多證據，務必證明他們幹下這起大屠殺。”

涉嫌策劃大屠殺的安帕圖安家族族長老安帕圖安、他的三個兒子和一個兄弟，將在馬尼拉的奎松市區域法庭面對審訊。這5人已被警方拘留。

最高法院基於安全考量，決定不讓棉蘭老島的法庭審理此案，而交由奎松市區域法庭審理。

老安帕圖安的第四個兒子小安帕圖安已在1月13日受審。小安帕圖安是這起案件的主謀。 蒙特內格羅說，針對那些已被拘留嫌犯的逮捕令已生效。

老安帕圖安目前被關押在棉蘭老島達沃市一家保衛森嚴的軍事醫院，他的兄弟和三個兒子則被拘留在另一個南部市鎮的警隊基地。

2010年4月19日，菲撤銷政治屠殺案嫌犯控狀。

菲律賓政府週六撤銷對政治屠殺案兩名嫌兇的控狀，屠殺案受害者家屬誓言將提出上訴。 代表一些家屬的私人檢察官羅克說：“我們將在法庭反對該命令。我們會提出上訴。” 他也說：“他們（家屬）感到憤怒，感覺被政府出賣了，並相信這是政治妥協。”

由於安帕圖安家族向來是阿羅約總統的政治盟友，而菲律賓即將舉行大選，因此當阿格拉在上月17日以證據不足爲理由，撤銷對兩名嫌兇的控狀時，許多人都質疑有關決定是否基於政治考量。

菲律賓檢察官過後籲請政府重新考慮，人權及媒體組織更是炮轟這個決定，屠殺案受害者家屬也誓言提出上訴。

2010年5月17日，菲律賓馬京達瑙省政治屠殺事件主謀、安帕圖安家族在省長選舉中落敗，失去了對該省的控制，當選省長的是在屠殺事件中失去妻子和兩個姐妹的曼古達達圖，曼古達達圖的親人是在爲他遞交競選省長文件的路上遭到殺害的，同時遇害的還有另外54人。

曼古達達圖說：“過程是痛苦的，但我很高興，因爲我達成了變革的夢想……惡勢力已被擊敗，我們擁有了自由。”

2015年7月17日，菲律賓馬京達瑙大屠殺案主要嫌犯之一、前馬京達瑙省省長安達爾·安帕圖安(老安帕圖安)17日深夜病死，針對他的多項犯罪指控終將不了了之。

代表遇害者曼古達達圖家族的律師桑托斯說，儘管老安帕圖安死了，針對其他被告的犯罪指控仍會繼續審理。代表多名遇害者家屬的律師哈里·羅格則表示，如果在老安帕圖安死前，法院就做出判決，對家人和被告本人都會更好。他強調，會繼續堅持不懈地代表遇難者家人討取公道。

馬京達瑙大屠殺案審判至今沒有進展，已引發菲國社會強烈質疑。菲國民間團體和遇害者家屬此前一直譴責該案審理進展過於緩慢，呼籲菲政府加快行動，終結有罪不罰的文化。

律師哈里·羅格之前曾建議，該案審判應效仿二戰後對德國納粹戰犯的紐倫堡審判，集中審判安帕圖安家族及參與策劃和殺戮的30多名兇嫌。

另據菲國媒體報道，2015年5月，馬京達瑙大屠殺案嫌犯之一、老安帕圖安的兒子薩吉德·安帕圖安獲得保釋，許多涉案嫌犯至今在逃。人權組織和遇害者家屬指控，陸續有證人遭到殺害或受到威脅。