對撞機這樣的大型基礎科研項目，從立項到建設和後期運行，保守估計將耗費大約200億美元，這樣的超級項目，已經逼近美國阿波羅登月計劃的經費預算。國內科研經費的總量是一定的，這個項目的上馬，必將擠佔其他科學項目的經費，例如生物技術，醫療健康等。楊振寧認爲目前粒子物理的發展難度越來越大，國內高能物理界試圖通過大型對撞機來發現新粒子，拿諾貝爾獎，這樣想法不錯，但可能性越來越小。各個先進國家也都減少在粒子物理上的研究投入。

　　CEPC就像資金黑洞，會把大量的科研經費吸進去，以使其他亟待資金投入的科研領域變得捉襟見肘。即便如此巨大的資金投入，在短時間內，CEPC也不一定能夠取得重大的發現。現在的理論物理學還沒有取得實質性的突破，不能給實驗指示一個明確的方向，耗費這麼多的資金只是去搏一把。雖然我國的經濟在過去幾十年裏已經取得了長足的發展，但我們還只是一個發展中國家，還有更多地方需要用錢。楊振寧教授認爲，這上千億元的資金更應該用於解決當前我國面臨的諸多迫切問題

　　高能粒子物理是一個燒錢的研究領域，建造一個超級強子對撞機至少需要上千億的資金，這些錢如果花在嫦娥登月上面，足夠支持到實現我國宇航員月球好幾次。而建成後，強子對撞機的日常運行和維護成本又很高，完全需要國家一直進行財政支持。可以肯定的說，強子對撞機就是一個燒錢的黑洞，有閒錢和時間的時候可以建一個玩玩，而我們這兩點都不具備。