Benjamin 通过RosettaVIP演算法对数据集测试: 结果显示演算法相比于RosettaDesign演算法可以更加准确地识别蛋白疏水内核的稳定型残基。并以人工重新设计的λ受体蛋白DNA结合结构域、Protein L进行内核优化,试验验证结果提示RosettaVIP均能解决重设计蛋白不稳定性的问题。
此外,他们团队也尝试将RosettaVIP应用于天然蛋白的设计,以eMAP为例,通过设计获得了含5个点突变的eMAP5,其Tm值提升17.6℃。并且经过回复突变验证,这5个点突变只有组合在一起时,才能起到强大的组合效应。