眾所周知,藥物篩選是發現藥物先導化合物的重要途徑,而好的化合物庫則是藥物篩選的必備武器。什麼是化合物庫呢?化合物庫是由特定結構或功能的實體化合物及其相關信息在某種特定的標準下組成的集合,通常作為新葯發現或者細胞誘導的工具來使用,幫助科學家找到新葯研發的苗頭化合物或者細胞特定功能的實現者。

化合物庫歸類的方法多種多樣,根據其性質和來源,市面上的化合物庫分為如下三大類:生物活性化合物庫,天然產物化合物庫和類葯多樣性化合物庫。下面就每一類進行詳細介紹:

? 生物活性化合物庫:市面上普遍使用的生物活性化合物庫涵蓋了4萬種生物活性已知的小分子,其中有些是已上市或臨床期的藥物;有些是經典的有明確靶點的活性小分子;有些是初步文獻報道表現出良好生物學活性的化合物。這些小分子可用於藥物功能重定位、細胞誘導、藥理研究、靶點確認等,屬於每個藥物篩選平台建立之初的基本配套產品。舉例來說,TargetMol的一套近兩千種的上市藥物庫就包含了市場上可以收集的各類疾病對應的化學藥物,其生物活性多樣性和化學結構多樣性都非常高,是一套性價比非常好的入門庫。同時,該類庫中還有很多廣受好評的經典化合物庫,如:FDA上市藥物庫,臨床藥物庫,抗腫瘤庫,生物活性經典庫和生物活性新穎庫等。

? 天然產物庫:天然產物來源豐富,取自植物,動物和微生物的細胞、組織或分泌物,種類繁多,結構多樣,含有糖類、糖苷類、苯丙素類、醌類、黃酮類、萜類、類固醇類、生物鹼類、酚類、酸類和醛類,是製藥行業獲得先導化合物的重要來源,常用作高通量篩選或計算機輔助藥物設計。

? 類葯多樣性化合物庫:目前世界上商品化的化合物有5000萬個,精選質量可靠,類葯多樣性好的產品組成類葯多樣性化合物庫,是多達數百萬個小分子化合物的集合,是科學研究、新的藥物靶點篩選的有效工具,是高通量篩選(HTS),高內涵篩選(HCS)和計算機虛擬篩選的不二選擇。這些產品一次可以為高通量篩選的平台提供1萬到20萬個性價比很高的類葯化合物庫,非常適合用於建設高通量篩選化合物庫平台。

除了高通量篩選的化合物庫以外,還有基於CADD(Computer Aided Drug Design)得到的各種潛在藥物靶點庫,如GPCR靶點庫,CNS靶點庫,抗菌庫,抗炎庫,抗HIV庫等。此外,一些特色化合物庫以其自身的性質特點為廣大藥物研發科學家提供了針對性很強的研究工具,包括片段庫、大環庫、靶向共價抑製劑庫等。比如近幾年很熱門的片段庫,其合理使用可以大大提高藥物篩選的結構覆蓋範圍,可用作基於片段篩選,科研人員可以根據其研究目標和方法進行單獨選擇,構建適合的片段大小和組成;而大環庫則包含了通常定義為包含超過12個碳原子或其他重原子的環結構,與等分子量的無環分子相比,大環化降低了分子整體極性並增強了膜的滲透性,可用於篩選某些挑戰靶點的先導化合物;靶向共價抑製劑是合理設計的抑製劑,這類抑製劑具有低化學反應性的成鍵官能團,其在與靶蛋白結合後,與靶位點上的特定親核殘基快速成鍵,因此具有較高的選擇性。

除了現有的化合物庫之外,完美契合需求的定製化合物庫也廣受歡迎。你不僅可以選擇需要的產品形式如粉末、溶液;還可以選擇包裝瓶或96孔板,甚至可以從產品的性質進行選擇,如上市且具有抗腫瘤活性的藥物等。

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