新北市三重衛生所2015年起假造公費流感疫苗數據，監察院通過糾正新北市政府、新北市衛生局和三重衛生所；由於國民黨新北市長參選人侯友宜當時是新北市副市長，外界不免產生聯想。對此，侯友宜辦公室今天(10日)回應，新北市衛生局接獲舉發後隨即展開調查，並沒有護短；侯辦表示，這是全國應該記取的教訓，期待監院除了調查新北市，疾管署也能補強中央機制。

新北市發生流感疫苗數據造假事件，媒體詢問查案監委，當時擔任新北市副市長的侯友宜是否要負起責任。監委蔡崇義表示，監察院不談選舉，責任問題應該問侯友宜本人。

侯辦發言人賴冠羣表示，新北市衛生局沒有護短，在接獲內部舉發後隨即將主管人員調離現職並移送檢調。他說，這是一個應該全國記取的教訓，在600萬劑疫苗中，高達31萬劑查無施打名冊，中央查覈機制明顯失靈，侯辦期待監院調查新北市外，疾管署也能就中央查覈機制予以補強。