查爾斯大學是中歐歷史上第一所大學，具有600多年的歷史，是捷克一流的大學，在捷克高校中綜合實力最強。大學設有神學院、文學院、醫學院、理學院、法學院、製藥學院、教育學院等17個學院。理學院設有生物學、化學、地理學、地質學、環境科學等學科，各學科的專業很齊全，其醫學、生物、法學、教育等各科的總體水平最強。

從基礎醫學方面看，捷克兒童基礎免疫水平居世界排名榜榜首，尤其是脊髓灰質炎的計劃免疫（1960年消滅脊髓灰質炎，列入世界最先消滅脊髓灰質炎的國家）和麻疹的計劃免疫（最新的醫學統計

兒科診治水平方面，查爾斯大學第二醫學院的教學醫院是中歐規模最大的醫院，兒科專業居世界領先地位，能診治各種兒科方面的疑難雜症，很多外國病人慕名來診療。

查爾斯大學第二醫學院強項專業是「同基因凝集技術」（屬醫學生物工程

公共衛生和工業環境毒素的研究達世界領先水平，實驗室設在捷克國家公共衛生管理中心。

查理大學世界排名：

2014USNEWS世界大學排名第179名

2013年WRWU世界大學排名第100名

2014年URAP世界大學學術表現143名

2013年上海交大世界大學學術排名（ARWU）綜合學術排名第204名（參照：中國科學技術大學290位）

2013年QS世界大學綜合排名第233名

查理大學專業排名：

2014USNEWS世界大學學科排名 物理排名 第66名

2014USNEWS世界大學學科排名 數學排名 第51名

2013年上海交大世界大學學術排名（ARWU）物理排名 101-150名

2013年上海交大世界大學學術排名（ARWU）數學排名 151-200名

2011年QS世界大學學科排名 材料科學排名 151-200名

2012年QS世界大學學科排名 經濟與計量經濟學排名 151-200名

2013年QS世界大學學科排名社會科學排名 151-200名

2014年QS世界大學學科地理學排名 51-100名

2014年QS世界大學學科語言學排名 51-100名

2014年QS世界大學學科排名地球與海洋科學排名 151-200名

2014年QS世界大學學科排名社會科學排名 151-200名

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