海印寺石門關位於金門縣金湖鎮太武山頂海印寺左前方，是清順治十八年（1661年，明永曆十五年）修建海印寺時的山門，距今有三百四十餘年，現在列為金門縣定古蹟。

金門的海印寺原為太武巖寺，最初建於宋代鹹淳年間（1265年至1274年），主祀通遠仙翁，與民間航海祈風習俗有關，至今仍有殘垣斷壁遺址的出士。金門舊屬泉州府同安縣轄治，宋人王國珍描寫泉州地區祈求通遠王的熱絡情形說：「吾泉以是德公為多，凡家無貧富貴賤，爭像而祀之，惟恐其後，以至海舟番舶，益用嚴格，公嘗往來於烈風怒濤間，穆穆瘁容於勻表，舟或有臨於難阻者，公易危而安之，風息濤平，舟人賴之以靈者十常八九」。宋代泉州開放為市舶司，金門的太武山也稱北太武山，與漳州的南太武山遙遙相對，同是閩南內陸河港出入放洋的望山。明初山頂設有倒影塔為航標，夜間點燃火把指引船舶航行順利平安。

明代對於太武山寺廟的奉祠記載並不多，倒是留下登山目睹景物，抒發情懷的詩品佳作；一向以品德完人的鄉賢黃偉題太武巖，詩曰：「落葉瀟瀟九月天，芒鞋緩步武巖巔。靜觀身外渾無物，未許人間別有仙。野徑黃花隨意折，暮雲紅日共誰延。何時宇宙長如旦，歷徧蒼崖詠石泉」。明代文人雅士登太武山賞景，盡興賦詩，列上十二奇景，分別為海印巖、玉几案、浸月池、眠雲石、偃蓋松、跨鰲石、石門關、蟹眼泉、倒影塔千丈壁、古石室、一覧亭等。石門關與古石室獨有幽奇之美，蔡發吾留存（詠太武山十二奇詩），其中吟詠石門關為：「歷徧風塵跣足還，峯頭依舊石為關。可鄰夜半未歸客，伸手無從露一斑」。

 

明代修建太武巖寺的記載，首見於明萬曆八年（1580年），金桂峯渡海緝賊，感於太武山靈神助之威，捐俸修葺，之後萬曆二十八年（1600年）又整修一次。

崇禎十七年（1644年）闖王李自成攻陷北京，崇禎帝自縊於煤山，清軍因吳三桂而破山海關南下，次年閏六月黃道周等在福州迎唐王朱聿鍵稱帝，改年號唐隆武。隆武二年（1646年，順治三年）八月，清兵進軍福建，隆武在長汀遇難﹔十月十四日桂王朱由榔在肇慶稱監國。十一月十八日宣佈即帝位，改明年為永曆帝號，同年十月中旬鄭芝龍接受清廷招降，旋即被挾持入京，鄭成功以忠義降清。十二月鄭成功在泉州安平誓師，並於金門的烈嶼大會南奔的文武羣臣，定盟恢復大明江山，四方義士歸附金門島上，金門籍的志節人士如明授兵部尚書盧若騰、東林人林習山、浦邊人周全斌、后豐港人洪旭、洪磊父子，都投郊反清陣營的行列中。順治八年（永曆五年，1651年）三月一日，清軍襲破廈門，乘勝進奪金門，海上適逢大霧瀰漫散，無法渡海攻取，金門逃過一刼，順治十三年（永曆十年，1656年）三月，清軍調度各澳船隻，並令泉州城守韓尚亮統領水師進犯廈門、金門，在海上忽遇颶風大作，清船欲收兵回泉州港及深滬港不得，有收圍頭被鄭成功兵將擄獲，有被浪打漂上青嶼、金門，登岸逃生乞降者，有飄至外洋黃海者，是役鄭師坐收大船十艘，大勝而返。這兩件振奮士氣的事件，島上軍民都認為是太武山上山靈禦災捍患的功勞，眾志一同的籌謀重建海印寺。次年盧若騰撰寫（募建太武寺疏），倡議修築太武寺，本籍人士周全斌與洪旭出力最多，他們都是鄭成功所器重的近臣，文中說：「山椒舊有棲神祠宇，祈禱多應。萬曆九年（1581年），劇賊越獄遁，邑侯金公躬渡海詣祠禱，賊旋受縛，亟捐俸倡紳士新之。歲久漸圯，念衷洪公、邦憲周公，皆浯產也，誠與神通，慨然為興復之舉」。最後在順治十八年（永曆十五年，1661年）初春動工，秋季全部完工，所有殿臺亭館都重建落成，盧若騰並寫下（重建太武寺碑記）紀念其興建始由：「上自勳鎮鉅公，下逮土著編戶，各伸願力，人數頗多，難於悉登諸石，乃備錄一匾，揭諸神祠，爰彰一時機緣之盛」。他也在海印寺的入口山門，以太武寺形勢居山海之勝景，親題「海山第一」四字，下款署名，因為後人所忌諱而磨掉，尚有「永曆辛丑十五年秋題」字樣。事後盧若騰仍時常的偕同友人登遊太武寺，在他的（遊太武巖詩）內文曾描述﹕「勝賞雖遲猶小春，同遊況復有芳鄰。深花木枝枝秀，無大洞天曲曲新。泉故噴香迎茗客，石爭呈面待詩人。雨奇晴好都經眼，澆盡世間萬斛塵」，附註提到：「辛丑春重建海印巖，其秋落成矣。冬閏洪鐘，特姻丈招同王愧兩、諸葛士年二先生來遊，次蔡清憲先生舊韻」。

經歷過幾個改朝換代，太武巖寺由建廟之初供奉的通遠仙翁，早已換成觀音如來。而海印寺的改建也不再是原有的廟制規模，獨留這座斑駁滄桑的石門關，一段南明往事興亡的史話，迴腸盪氣的英雄壯志，正呼應著太武山的思古幽情，似乎一切都要從這座山門訴說起，登金門的太武山和造訪海印寺，切莫忘記駐足尋找石門關的史蹟源流，追思先賢的民族氣節情操。