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如何看待華南農業大學發現穿山甲為新型冠狀病毒潛在中間宿主?具體情況是怎樣的,有何意義??

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20200207結尾更新彩蛋,快破案了?


——原答案——

今天(20200206),華南農的新聞發布會引爆了輿論,他們聲稱從穿山甲裏分離到一株與新型冠狀病毒2019-nCoV序列相似度在99%的病毒。

這給出了非常強烈的證據,暗示穿山甲是這次疫情主角新型冠狀病毒的中間宿主

我們以此為事實出發,來探尋新型冠狀病毒起源於何處?

原文首發 知識星球·真知拙見 Knowledge Hot #武漢新型冠狀病毒專題# https://t.zsxq.com/ByvNBQJ

並同步發佈於個人知乎專欄—— 病毒學筆記

脈絡終於清晰,新型冠狀病毒來自何方??

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一、病毒源頭在哪?

一篇國際雜誌編輯部在去年(2019)9月30號收到的手稿,是第一次證實穿山甲可以攜帶冠狀病毒的報道[1]。【記住時間節點】

這裡面作者提到,廣東野生動物救助中心在2019年3月24日從緝私局處獲得了21隻馬來亞穿山甲。而絕大多數穿山甲的健康狀況都很糟糕。【記住時間節點】,雖然救助中心做了很大努力,但是還是死了16隻,而且絕大多數穿山甲的癥狀有肺腫脹並含泡沫樣積水, 肺纖維化、部分個體還有肝脾腫大。隨後作者對其中死亡的11隻個體採樣,包括肺臟、淋巴和脾臟進行高通量測序。結果比對發現很多病毒的閱讀序列,包括副黏病毒(比如仙台病毒),其中有兩隻個體發現有冠狀病毒的序列

而後他們又對測到的冠狀病毒與現有的冠狀病毒進行比對,發現在穿山甲裏測序出來的冠狀病毒與蝙蝠裡面的SARS樣冠狀病毒的序列相似度非常接近。

他們把相關序列提交至NCBI,代碼是PRJNA573298。


二、病毒怎麼進化的?

而幾天前,在流感病毒序列分享網站(最早的新型冠狀病毒序列分享的網站)[2]上出現了一篇預印本論文的數據集[3]。他們乾的事是把2019-nCoV上面S蛋白結合受體的結構域——RBD進行了比對,發現這部分氨基酸的序列與廣東野生動物救助中心提交的、從穿山甲裡面測序出來的冠狀病毒的RBD序列的相似度在97%!!!

而之前武漢病毒所石正麗團隊提交的論文表示[4],2019-nCoV的全序列與一株蝙蝠來源的RaTG3毒株相似度很高,達到96.2%。但是最大的差異在S蛋白上。其中與S-RBD的序列相似度在93.1%

曾鑒定出非典源頭的石正麗團隊發表研究,新型冠狀病毒受體與非典病毒相同,還有哪些關鍵信息??

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這兩部分的結果表明在武漢開始傳播的新型冠狀病毒很可能是從蝙蝠跳躍至穿山甲,並在穿山甲中可能發生了病毒重組,利用了穿山甲中冠狀病毒的S蛋白的受體結合結構域。


三、病毒是如何在武漢傳播開來的?

根據上面的結論,病毒的傳播路徑已經比較清晰了。

緝私局查獲的馬來亞穿山甲來自於東南亞,而石正麗研究員分離到序列最接近的毒株RaTG3也是來自於雲南的一個蝙蝠洞。雲南緊貼西南邊境,而野生動物並不會被國境線所限制,蝙蝠可以飛,穿山甲也可以過。所以在這裡可能因為蝙蝠與穿山甲的接觸導致了冠狀病毒的第一次種屬跨越。

而緝私局查獲的這批21隻穿山甲可能並不是當時的全部贓物。

可能有其他的漏網之魚,而這些漏網之魚很可能通過一定的運輸途徑運到了武漢華南海鮮市場,並且進行這批穿山甲走私的人員很可能就是第一批被感染人羣,而接手穿山甲並進行運輸的人員可能也是比較早期的患者,0號病人可能就在這兩種人羣中間。而在海鮮市場的聚集性病例,是我們第一時間得知病毒發生第二次種屬跨越的結果。

也就是說,走私、運輸穿山甲可能導致了病毒的第二次跨越種屬,這時候病毒可能就具備了人傳人的能力。這些人羣作為最初的傳染源導致了後續的病例暴發。

但是也不能排除海鮮市場在接貨時候,海鮮市場相關人羣是被人傳人感染的,還是在這裡又一次發生了病毒的種屬跨越,也就是病毒從穿山甲到市場相關人員人。

所以,現在回溯調查穿山甲走私和運輸情況很可能能確定最初的傳染源。

可以準備拍電影了。


四、想說的話!

沒有買賣就沒有殺害!!

有人評論裏提供了一個關鍵信息——

時間點非常吻合,難不成真是電影導演。

(不保證準確性)

這難道就是0號病人?因為找「藥方子」傳染了海鮮市場?


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www.zhihu.com圖標鍾南山院士稱新型冠狀病毒傳染性比 SARS 最強時弱,兩者對比如何?從非典我們學到了什麼??

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參考

  1. ^Viral Metagenomics Revealed Sendai Virus and Coronavirus Infection of Malayan Pangolins (Manis javanica). Viruses 2019, 11(11), 979; https://doi.org/10.3390/v11110979
  2. ^http://virological.org/t/ncov-2019-spike-protein-receptor-binding-domain-shares-high-amino-acid-identity-with-a-coronavirus-recovered-from-a-pangolin-viral-metagenomic-dataset/362
  3. ^Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV. doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.22.915660
  4. ^A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. https://www.nature.com/articles/s41586-020-2012-7


當年SARS-CoV和MERS-CoV爆發時,研究人員做了大量研究工作。

推測現在所有的冠狀病毒起源於原始冠狀病毒(Coronavirus ancestor),原始冠狀病毒分成兩支,一支以蝙蝠為宿主,另一隻以鳥類為宿主,其中以蝙蝠為宿主的冠狀病毒不斷擴展宿主範圍,進化成能侵染多種哺乳動物的 Alphacoronavirus 和 Betacoronavirus,而以鳥類為宿主的冠狀病毒也不斷進化,進化成以鳥類和哺乳動物為宿主的Gammacoronavirus 以及以鳥類和少數哺乳動物為宿主的 Deltacoronavirus[1][2]

確定SARS-CoV的天然宿主是蝙蝠,由於蝙蝠是最古老的哺乳動物,病毒利用其體內高度保守的受體進化,增強了病毒傳播到其他動物體內的能力。同時,蝙蝠體內缺少B細胞介導的免疫反應,所以它們能夠攜帶病毒但並不表現出相應的癥狀。冬眠的生活習性,也使得一些蝙蝠代謝效率和免疫反應降低,這也就導致了蝙蝠對體內病毒的清除效率明顯減緩。此外,蝙蝠屬於羣居動物,這也有利於病毒在羣體間穩定的傳播和進化。不僅如此,由於具有飛行能力,它們的活動範圍廣泛,所以也極有可能將體內攜帶的病毒傳播出去。蝙蝠的食性廣泛,在它們的進食過程中,病毒可能通過口腔和排泄物傳播給其他可能的宿主。綜上我們可以看出,蝙蝠的生物學和生態學特徵決定了它們是自然界中多種病毒的理想天然宿主[3]

在研究中間宿主時,從如下幾個方面入手:

首先,從第一例患者的居住地和工作地入手,所謂中間宿主,一定是患者比較容易接觸的; 其次,是從分子層面分析,利用RT-PCR法檢測病毒,對比與SARS-CoV的同源性;

再次,刺突蛋白S的同源性和結構的相似性,我們都知道,在病毒感染宿主的過程中,最重要的兩個蛋白,一個是來自病毒的刺突蛋白S,另一個是來自人的受體(SARS-CoV和NPC都是ACE2),所以,S蛋白的同源性極為重要;

最後,在宿主體內是否能檢測到抗體。

確定了SARS-CoV的中間宿主是果子狸。

紅色氨基酸和「+」表示克服種間屏障有利於SARS-CoV跨種傳播的RBD突變;綠色氨基酸和表示形成種間屏障不利於SARS-CoV跨種傳播的ACE2突變[4]

根據華南農業大學官方報道:華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室沈永義教授、肖立華教授等科研人員聯閤中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院楊瑞馥研究員及廣州動物園科研部陳武高級獸醫師開展的最新研究表明,分離出來的冠狀病毒病毒株與此次病毒序列相似度99%,故穿山甲為此次在武漢大面積爆發的新型冠狀病毒潛在中間宿主。

在此之前,多篇研究論文發表,證實此次NCP的自然宿主可能與其他冠狀病毒一樣是蝙蝠; 接著1月22日的研究論文給予蛇的RSCU偏差類似,表面蛇可能是中間宿主;1月25日,研究人員通過比較脊椎動物宿主的所有病毒感染模型,得出水貂可能是是中間宿主。

這些結論的得出過程,都有一定的依據,但是論據並不完美。

但是至少這些研究工作,將藏在暗處可能的中間宿主都揪了出來,對於目前從源頭防控冠狀病毒有重要意義。

而且,水貂、蛇、穿山甲都得救了不是麼?他們可能很長一段時間內都不會出現在人類的餐桌上了。


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參考

  1. ^王年爽. 中東呼吸綜合徵冠狀病毒MERS_CoV的受體識別機制研究, 2014
  2. ^PC Woo, SK Lau, CS Lam, et al. Discovery of seven novel Mammalian and avian coronaviruses in the genus deltacoronavirus supports bat coronaviruses as the gene source of alphacoronavirus and betacoronavirus and avian coronaviruses as the gene source of gammacoronavirus and deltacoronavirus. J Virol, 2012, 86(7):3995-4008
  3. ^袁園.MERS_CoV和SARS_Co_RBD及其與受體相互作用的結構與功能研究
  4. ^Li F. Receptor recognition and cross-species infections of SARS Coronavirus. 2013


穿山甲也是哺乳動物,所居住的環境可能遇到蝙蝠的食物殘渣或者排泄物。

另外,還是想強調一下!

穿山甲片不要再當作中藥了。

不通乳,不下奶,沒用的。


很多人現在看病都靠百度,我試著百度一下:

看來很多人看肺病還是需要殺一些穿山甲的。

不管這病毒是蝙蝠拉屎拉在穿山甲附近,還是蝙蝠和穿山甲一起去買菜了,反正我們沒見過戴口罩的穿山甲。

希望國家在開展新冠肺炎的診治同時,認真加大野生動物買賣的查處力度,並立法,嚴懲買賣、獵殺、烹調和購買野生動物的行為。因為喫野生動物對我們社會和國家是有百害無一利的!


2月7日,華南農大召開新聞發布會,肖立華教授在會上介紹,「已鎖定穿山甲為新型冠狀病毒的潛在中間宿主」[1]。

一時間,關於穿山甲和野生動物的討論風雲再起,但同時也引起了一些爭議。

這個結論的證據充分嗎?讓我們來仔細分析一下。

為什麼找到中間宿主這麼重要?

新冠肺炎疫情發展到今天,專家們已經基本確定此次新型冠狀病毒起源於蝙蝠。但關鍵問題是,蝙蝠攜帶的病毒在正常條件下不能直接感染人類,這就需要一個中間宿主。所謂中間宿主,就是蝙蝠先把身上的病毒傳給其他動物,當人食用或宰殺這些野生動物時,病毒再傳遞到人身上。說白了,就是一個轉運病毒的「中間商」。所以,找到新型冠狀病毒的「中間宿主」非常重要,只有找到它才能切斷源頭,防止病毒再傳染給人類。但要確認 「中間宿主」,嚴謹、公認的科學流程是這樣的:1.在「中間宿主」體內分離到了可以在它體內繁殖複製的病毒;2.分離出的病毒能夠在動物模型上顯示致病性和病理特徵等;3.確認病毒在感染傳播鏈中的位置(是通過攜帶病毒的動物感染人,還是已經感染病毒的人會再感染動物)等等。

此前,有科學家發表文章稱「蛇」可能是中間宿主,這與流行病學和進化論存在一定偏差。因為「蛇」是爬行動物,直接作為蝙蝠和人類這兩種哺乳動物中間宿主的可能性比較小。

穿山甲可能是「中間宿主」嗎?

華南農業大學、嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室教授肖立華表示[1]:「圍繞冠狀病毒有可能的動物來源,我們開展了溯源工作,對多種野生動物的宏基因組進行了分析,鎖定了穿山甲。」

  • 研究人員通過分子生物學檢測發現,穿山甲中β冠狀病毒的陽性率為70%;
  • 進一步對病毒進行分離鑒定,電鏡下觀察到典型的冠狀病毒顆粒結構;
  • 最後再對病毒進行基因組分析,發現分離到的病毒株與目前感染人的毒株序列相似度高達99%,確定穿山甲是可能的潛在宿主。

但是,從媒體發布的信息來看[2],目前從穿山甲中分離到的病毒基因序列只是其中一部分。

也有專家提出不同的意見:「按照流行病學原理,那麼多販賣、捕殺穿山甲的人應該早就發病了。」

要想最終確定穿山甲是不是中間宿主,科學家至少還要解答下面的5個問題:

1.完整的穿山甲病毒基因序列,目前大約有4000個還沒有測序。

2.真實情況中病毒從穿山甲傳播到人的證據,也就是在武漢當地,穿山甲和人到底是怎樣接觸的。3.新型冠狀病毒是不是真的能同時感染人類和穿山甲?

4.再找幾隻未感染的穿山甲做感染實驗,看它們會不會發病、出現癥狀或產生抗體。

5.用人類細胞做研究,確認穿山甲的冠狀病毒是不是真的能感染人體細胞。

如果穿山甲是「中間宿主」,可能通過哪些途徑感染到人呢?

如果穿山甲是中間宿主,就要弄清它究竟怎麼從海鮮市場傳染給人的,這個問題很關鍵。根據中國疾控中心1 月 27 日發布的《2019 新型冠狀病毒疫情進展和風險評估報告》[5],從華南海鮮市場的585份環境樣本中,檢測到33份樣品含有新冠病毒核酸。新冠病毒可能是在 2019 年 12 月初從湖北省武漢市華南海鮮市場的某種野生動物外溢、通過污染市場環境而感染人,再造成人與人之間的傳播。2003年的SARS疫情,科學家就直接追查到了廣東野生市場販賣的果子狸,最後發現它們身上的病毒和人類SARS病毒完全一樣。但同時又發現,全國各地的養殖果子狸和野生果子狸身上並沒有這種病毒!這一點不僅證明瞭果子狸是SARS的中間宿主,還證明瞭一個真相:販賣、宰殺果子狸纔是導致SARS病毒傳給人類的罪魁禍首。如果當初封閉市場時,保留了華南海鮮市場的穿山甲樣本;如果能找到華南海鮮市場或武漢/湖北其他野生動物市場的穿山甲,和野外穿山甲再做對比,答案才會更清晰。據澎湃新聞報道,沈永義在發布會上也提到:「華南海鮮市場早就消毒了,再往前溯源是比較難的,我們後續要做更多工作來證明這條傳播鏈條。」

科學家們需要做的工作還有很多。

關於穿山甲,你可能還不知道這些

全球現存的穿山甲有8種,我國主要為中華穿山甲、印度穿山甲(馬來穿山甲是否屬於本土物種存在爭議),前者分佈在長江以南各省、海南島和臺灣省,後者僅分佈在雲南省局部地區。中華穿山甲是我國二級保護動物,在我國基本處於極度瀕危的狀態。它是哺乳動物,愛喫白蟻,喜歡在夜間活動,居住在丘陵山地的樹林、灌木叢、草芒等地方。為了找到白蟻,穿山甲會挖0.3~2米的洞,然後住在洞裏[3]。

中藥「通經下乳」處方中的中藥成分就是穿山甲的「甲」,而且只有中華穿山甲的甲片被《中國藥典》收錄。它的肉也成為人類炫耀的資本,我國民間自古認為它的肉是「滋補極品」。

入葯的穿山甲鱗片

在過去的20年裏,全球大約有200萬隻穿山甲被捕殺。但其實穿山甲的甲片成分、藥效、替代品研究都存在爭議,沒有明確的結論。近年來,有研究認為豬蹄甲的藥用價值和穿山甲甲片相差無幾,但還沒有可靠的研究結論[4]。 實際上,穿山甲最大的貢獻價值並不是它的肉和鱗片。一隻3~4千克的穿山甲每天能捕捉300~400克的白蟻,在一片面積為200~250畝的森林裡,一隻穿山甲就能夠保護整片森林免受白蟻所害,堪稱「森林護衛隊」。可能有人會問,不能通過人工馴養繁育來解決人類對穿山甲的狂熱需求嗎?還真不能,穿山甲的習性特殊、比較原始,對自然生態系統的依賴性非常大,要提供這樣的環境並不容易。而且穿山甲只喫螞蟻和白蟻,人工提供食物都存在困難。它們的體溫調節功能也不太好,日常體溫在31~35℃,又缺乏先天的免疫基因,如果人工圈養,多數會因為管理不善而死亡。

需要強調的是,野生穿山甲已經非常稀少,即使停止捕獵,要恢復穿山甲的種羣也非常困難。

常年從事穿山甲研究的華南師範大學吳詩寶教授在2009年接受媒體採訪時表示:20多年來,他唯一一次在野外與穿山甲打了個照面,還是1993年在廣東茂名市的山區。對自然環境和人類這麼有幫助的動物,卻被人類捕殺到即將滅絕。大自然的懲罰,也在悄然降臨……

正如董卿在央視主持人大賽上那句經典評論:「槍響之後,沒有贏家」。

參考文獻

[1]每日經濟新聞. 華南農業大學:從穿山甲中分離出的毒株與新冠毒株相似度達99%[EB/OL]. http://www.nbd.com.cn/articles/2020-02-07/1406234.html

[2]財新網. 研究稱穿山甲為新冠潛在中間宿主 專家認為需更多證據[EB/OL]. http://science.caixin.com/2020-02-07/101512695.html?cxw=IOSSfrom=WechatoriginReferrer=iOSshare

[3]吳詩寶,劉迺發,馬廣智,等. 穿山甲生態學研究概況[J]. 動物學雜誌,2004,39(2):46-52.

[4]唐兆民. 穿山甲:即將被「喫絕」的物種[J]. 生態經濟,2017,33(5):6-9.

[5]中國疾病預防控制中心. 2019 新型冠狀病毒疫情進展和風險評估報告[EB/OL]. http://www.chinacdc.cn/jkzt/crb/zl/szkb_11803/jszl_11811/202001/P020200127544648420736.

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