看完《白蛇傳》後,宮崎駿失魂落魄地回到家中,想到白娘子那樣堅忍,再看看自己沒有出息的樣子,他坐在火爐邊哭了一整晚,而一些東西卻在他的內心深處悄悄起了變化。之後,宮崎駿咬著牙,於1959年考入了日本東京學習院大學政治經濟學部,主攻日本產業論,這是一所原本專為皇族和貴族服務的學校,所以同學不是親王公主,就是高富帥,文化水平參差不齊。由於宮崎駿自幼立志要成為漫畫家,但當時的日本大學還沒有漫畫社,因此他加入了性質最為接近的兒童文學研究會,期間並編導了幾部人偶劇,他的故事創作才華也由此嶄露頭角。大學期間,宮崎駿熱衷於漫畫創作,積累了數千張畫稿。
然而就在那個時候,宮崎駿卻突然停止了向媚俗的漫畫雜誌投稿,並表示不想再當漫畫家了。一方面是由於他發現自己在畫漫畫上的天賦有限,無法超越手塚治虫這樣的大師,甚至當聽到有人對他說「你這漫畫是模仿手塚治虫的吧」,他乾脆就把作品都燒了,連看手塚治虫的動畫片《露滴》《埃及女王》等他都感到「直犯噁心」;另一方面也是因為他對白娘子一直念念不忘,決定要進東映動畫公司,拍《白蛇傳》那樣的嚴肅動畫片,甚至由於心中有白娘子,連第二外語他也選修了中文。