為因應共軍「遠海長航」機艦繞台，殲-20服役實施夜航全天候作戰的敵情威脅，國軍將原部署本島西部的愛國者飛彈移防花東，擔負空防任務，原計畫在台北都會區以3個飛彈連形成「下弦月」防禦弧線的反飛彈計畫已遭棄置，北部只剩兩個愛國者飛彈連固守；而移防東部的愛國者3型（PAC-3）防空飛彈，為考量實戰運用，除在漢光34演習實兵操演中完成野戰陣地部署驗證外，平時也前推至機場跑道旁，搭配發電站與取彈車實施24小時戰備，實施機場防衛。

愛國者3型防空飛彈部署，目前在北部計有新北市安坑、台北市南港兩處陣地，原萬里陣地成為空置營區；台中則有太平（坪林）、清泉崗機場與嘉義水上機場；南部則有台南新化、高雄拷潭、屏東機場；東部則為花蓮機場、台東機場。這10處陣地中，就有5處陣地緊臨機場周遭，建設飛彈連陣地。而愛國者是機動系統，部隊駐地未必就是真正未來接戰的部署位置，戰時需疏散至田野中的預備陣地，國防部已完成東部野戰陣地部署驗證。

國軍過去採購愛國者飛彈，強調優先部署大台北都會中樞要域，一個營3個連兵力進駐安坑、南港、萬里3處，形成反飛彈防禦弧線；但中共實施「遠海長航」戰機繞越東部後，萬里陣地去年起就被取消部署，並由中南部飛彈連抽調兵力移防東部，進駐花東機場周邊。將領透露，當年愛國者進駐萬里，本非反飛彈考量，而是弭補北部空防間隙；如今東部因應共軍繞台成為空防要地，愛國者因此優先移防，集中實施機場防衛與防空任務。中南部也未再以都會防禦為優先。

國軍在各軍機場旁建設愛國者3型飛彈駐點，包含陣地與營連部，均採就地部署，少數前推至機場內的發射車，也是在機場內隱蔽；但東部機場近期精進戰力部署，將愛三飛彈發射車搭配發電站、取彈車，直接部署在機場跑道旁，確保跑道運作順暢。

高層將領表示，國軍全面落實不對稱作戰，是體認到資源有限，無法與共軍進行消耗戰，因此所有的資源都必須用在刀口上，用在最必須、對我方最能發揮效力的位置。愛國者3型飛彈與天弓3型飛彈雖具備截擊敵人彈道飛彈的能力，但成本極高，無法將所有敵方可能攻擊的設施都列入防護。國軍現階段最優先需要保障者，是我方機場等軍事設施，盡可能在對方飛彈攻擊下，仍能減少傷害，維持運作，確保空軍各型戰機能順利升空。