TCGA lncRNA構建Cox回歸發文好發到爆
今天,我們給大家分享一篇利用TCGA lncRNA構建Cox回歸發文的文章,這篇文章發表在J Cell Biochem上,該期刊IF達到2.959,這篇文章主要是通過對TCGA 胃癌 lncRNA構建多因素Cox回歸模型,發現了3個biomarker。
這篇文章題目:A prognostic 3‐long noncoding RNA signature for patients
with gastric cancer
文章鏈接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=A+prognostic+3%E2%80%90long+noncoding+RNA+signature+for+patients+with+gastric+cancer
這篇文章大體思路:
1、下載TCGA胃癌lncRNA數據
2、對lncRNA做差異分析
3、將差異的lncRNA進行單因素Cox(初步篩選變數)
4、lasso回歸(進一步篩選變數)
5、將lasso回歸篩選出來的lncRNA構建多因素Cox
6、生存分析
最終,確定了三個lncRNA可以做為胃癌的biomarker。
希望本文對對大家有幫助。
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